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二花脸猪ABCG8基因的蛋白功能与组织表达分析
文献摘要：
ABC转运蛋白8(ABCG8)基因与家畜抗逆性相关,为探究猪ABCG8编码的蛋白功能及其在各组织中的表达,通过PCR技术克隆二花脸猪ABCG8基因,使用在线生物信息学方法分析ABCG8质结构与功能,利用qRT-PCR检测其组织差异性表达分析.结果表明:该蛋白子式为C3638H5712N982O1027S35,编码 730 个氨基酸,分子量为 80761.43 kD,pI 值为 8.73,GRAVY值为0.071,属于疏水蛋白.该蛋白存在109个潜在的N-磷酸化位点和6个O-糖基化位点,不存在信号肽序列,二级结构主要由α螺旋(43.01％)、β-转角(6.16％)、延伸链(14.52％)和无规则卷曲为(36.30％)组成,主要定位在细胞膜和内质网,是定位于细胞膜上的多次跨膜蛋白,可能与 ABCG5、NPC1L1、CYP7A1、NR1H3、SCARB1、SREBF2、APOA1、NR1H2、SQLE、NR1H4等蛋白存在相互作用关系.此外,ABCG8基因在二花脸猪各组织中的表达谱分析表明,ABCG8基因在肝脏组织中的表达量最高,小肠次之,在其他组织中几乎不表达.研究结果为进一步研究ABCG8在猪生长性能和肉质性能调控中的机理研究奠定了基础.
文献关键词：
二花脸猪;ABCG8;生物信息学分析;组织表达
中图分类号：
作者姓名：
周欣怡;张金璧;陈宽凤;倪佳怡;丁悦;徐世永;程泽信
作者机构：
金陵科技学院动物科学与食品工程学院,江苏 南京 210000
文献出处：
引用格式：
[1]周欣怡;张金璧;陈宽凤;倪佳怡;丁悦;徐世永;程泽信-.二花脸猪ABCG8基因的蛋白功能与组织表达分析)[J].福建农业科技,2022(06):1-7
A类：
C3638H5712N982O1027S35,SCARB1,SREBF2,NR1H2
B类：
二花脸猪,ABCG8,蛋白功能,组织表达分析,转运蛋白,家畜,抗逆性,生物信息学方法,结构与功能,qRT,组织差异性,差异性表达,白子,子式,分子量,kD,pI,GRAVY,疏水蛋白,磷酸化,糖基化位点,信号肽,肽序列,二级结构,无规则,卷曲,细胞膜,内质网,跨膜蛋白,ABCG5,NPC1L1,CYP7A1,NR1H3,APOA1,SQLE,NR1H4,相互作用关系,表达谱分析,肝脏组织,小肠,他组织,生长性能,肉质,性能调控,生物信息学分析
AB值：
0.387307
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