典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗骨癌痛的作用机制
文献摘要：
目的 选择运用网络药理学与分子对接的方式,针对传统中药材鸡血藤治疗骨癌痛(bone cancer pain,BCP)的分子机制作出探讨,为中药治疗BCP提供新的理论依据.方法 在中药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)中,将检索关键词选择为鸡血藤,同时将筛选条件定为口服生物利用度(oral bioavailability,OB)、类药性(drug likeness,DL)分别≥30％与0.18,由此即可以得到鸡血藤内部的有效活性成分与其潜在靶点.合理运用R软件与Perl软件进行脚本运行对潜在靶点基因作出注释.运用Genecards、OMIM数据库汇集BCP相关疾病靶点,将BCP相关基因和鸡血藤活性成分相关靶点在Perl脚本运行后可得到相交靶点并在STRING数据库对其进行导入,完成蛋白网络的创设.选择Cytoscape 3.7.1软件创设"鸡血藤-活性成分-靶点-骨癌痛"相互关系网络.同时选择利用R软件完成相交靶点GO功能与KEGG通路的富集分析,并且针对最终结果开展可视化处理工作.选择运用Metas-cape在线数据库富集分析相交靶点的分子功能、生物过程与细胞成分,并对其做出可视化处理.选择AutoDock软件来完成核心化合物与核心靶点的分子对接.结果 鸡血藤在TCMSP数据库中其活性成分共计23种,预测靶点数110个.在Genecards、OMIM数据库中获得BCP相关靶点10 250个.鸡血藤和BCP两者的相交靶点共102个;利用PPI蛋白网络筛选出10个核心靶点:AKT1、EGFR、MAPK1、JUN、MYC、VEGFA、CASP3、IL-6、STAT3、PTGS2;GO富集分析结果:分子功能、生物过程和细胞成分分别达到141、1 630和81个;KEGG结果共涉及166条通路,选择富集程度高的前20条做可视化处理.分子对接结果表明鸡血藤治疗BCP的过程中,前7位核心化合物分别与AKT1、EGFR、MAPK1、JUN、MYC、VEGFA、CASP3、IL-6、STAT3具有良好的结合性能.结论 此次研究主要是针对鸡血藤治疗BCP的多成分、多靶点与多通路的具体作用与机制作出浅显的分析与探究,通过网络药理学和分子对接结果可以证实鸡血藤具有治疗BCP的潜在分子机制,为临床上应用中药治疗BCP提供更丰富的理论依据.
文献关键词：
骨癌痛;鸡血藤;网络药理学;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
梁艳芳;王爱桃
作者机构：
内蒙古医科大学,呼和浩特 010059;内蒙古自治区人民医院麻醉二科,呼和浩特 010017
文献出处：
引用格式：
[1]梁艳芳;王爱桃-.基于网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗骨癌痛的作用机制)[J].内蒙古医学杂志,2022(12):1416-1421,封3-封4
A类：
B类：
鸡血藤,骨癌痛,网络药理学与分子对接,传统中药,中药材,bone,cancer,pain,BCP,中药治疗,系统药理学,Traditional,Chinese,Medicine,Systems,Pharmacology,TCMSP,词选,口服生物利用度,oral,bioavailability,OB,类药性,drug,likeness,DL,活性成分,潜在靶点,合理运用,Perl,行脚,脚本,靶点基因,Genecards,OMIM,汇集,相关疾病,相交,STRING,成蛋白,蛋白网络,Cytoscape,关系网络,富集分析,可视化处理,Metas,生物过程,细胞成分,AutoDock,成核,核心靶点,PPI,AKT1,EGFR,MAPK1,JUN,MYC,VEGFA,CASP3,STAT3,PTGS2,结合性能,多成分,多靶点,多通路,具体作用,作用与机制,浅显,分析与探究,有治
AB值：
0.315463
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