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典型文献
坛紫菜PhGME基因克隆及差异表达分析
文献摘要:
GDP-甘露糖-3,5-表异构酶(GME)是抗坏血酸合成过程中的关键限速酶.以坛紫菜(Pyropia haitanensis)转录组测序获得的unigene序列为基础,采用普通PCR技术克隆获得了坛紫菜编码GME的基因序列PhGME.序列分析结果表明,PhGME基因序列全长1411 bp,包含一个1260 bp的开放阅读框,所编码的多肽包含419个氨基酸,相对分子质量为46.46 ku,理论等电点为6.76,具有GME特有的底物结合位点.多序列比对和系统进化树分析结果显示,PhGME与角叉菜同源且关系较近.差异表达分析结果表明,随着高盐胁迫时间的增加,TK品系处理组坛紫菜PhGME基因的表达水平均显著高于对照组,同时TK品系的AsA含量在胁迫处理6 h后明显增加.由此推测该基因的上调表达可能有助于抗坏血酸的合成,进而调控藻体抵抗盐胁迫.以上结果说明,PhGME在坛紫菜应对盐胁迫过程中发挥着重要作用,为坛紫菜抗逆功能的研究提供了理论参考.
文献关键词:
坛紫菜;GDP-甘露糖-3;5-表异构酶;基因克隆;抗坏血酸;盐胁迫
作者姓名:
魏鹏华;王文磊;许凯;徐燕;纪德华;谢潮添;陈昌生
作者机构:
集美大学水产学院,福建 厦门361021;福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心,福建 厦门361021;农村农业部东海健康养殖重点实验室,福建 厦门361021
引用格式:
[1]魏鹏华;王文磊;许凯;徐燕;纪德华;谢潮添;陈昌生-.坛紫菜PhGME基因克隆及差异表达分析)[J].集美大学学报(自然科学版),2022(02):97-106
A类:
PhGME
B类:
坛紫菜,基因克隆,差异表达分析,甘露糖,异构酶,抗坏血酸,合成过程,限速酶,Pyropia,haitanensis,转录组测序,unigene,基因序列,序列分析,全长,bp,开放阅读框,多肽,相对分子质量,ku,等电点,底物,结合位点,多序列比对,系统进化树分析,角叉菜,高盐胁迫,TK,品系,AsA,胁迫处理,抗盐,抗逆功能
AB值:
0.283365
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