典型文献
高粱LKR基因结构及在种子发育中的表达特征分析
文献摘要：
高粱是优质的酿造原料和饲料作物,但高粱籽粒中缺乏赖氨酸,影响了高粱的营养价值,其中,赖氨酸酮戊二酸还原酶/酵母氨酸脱氢酶(LKR/SDH)是赖氨酸降解途径的关键酶.为修饰赖氨酸酮戊二酸还原酶、减少赖氨酸的降解、提高高粱籽粒营养品质的研究提供数据支持,基于高粱基因组数据库,应用生物信息学方法分析了高粱LKR基因的结构、保守结构域等,预测了其蛋白的二级、三级结构、理化性质和系统进化关系,并采用实时荧光定量PCR检测LKR基因在高粱种子不同发育阶段的表达特性.结果表明,高粱LKR基因定位在4号染色体上,有4个保守结构域.预测结果发现,高粱LKR蛋白二级结构主要为α-螺旋,其三级结构为α-β结构类型;该蛋白是亲水的不稳定蛋白,无跨膜结构,并且没有信号肽,属于非分泌蛋白.此外,高粱LKR蛋白有14种蛋白激酶位点,磷酸化的位点主要是丝氨酸Ser(45个)、苏氨酸Thr(37个)、酪氨酸Tyr(12个).系统进化树分析表明,高粱与玉米的ZmLKR基因相似性达94.33％.通过qRT-PCR分析发现,授粉后20 d的高粱籽粒中LKR基因表达量最高.
文献关键词：
高粱;赖氨酸酮戊二酸还原酶;生物信息学;种子发育时空表达
中图分类号：
作者姓名：
李欣宇;徐启宇;卫宇翔;王景雪
作者机构：
山西大学 生命科学学院,山西 太原 030006
文献出处：
引用格式：
[1]李欣宇;徐启宇;卫宇翔;王景雪-.高粱LKR基因结构及在种子发育中的表达特征分析)[J].山西农业科学,2022(12):1591-1598
A类：
LKR,赖氨酸酮戊二酸还原酶,酵母氨酸,ZmLKR,种子发育时空表达
B类：
基因结构,表达特征,酿造原料,饲料作物,高粱籽粒,营养价值,SDH,降解途径,关键酶,籽粒营养品质,质的研究,基因组数据,生物信息学方法,保守结构域,三级结构,进化关系,发育阶段,表达特性,基因定位,蛋白二级结构,其三,结构类型,亲水,膜结构,信号肽,非分,分泌蛋白,种蛋,蛋白激酶,磷酸化,丝氨酸,Ser,苏氨酸,Thr,酪氨酸,Tyr,系统进化树分析,qRT,授粉,基因表达量
AB值：
0.264316
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