典型文献
miR-182-5p在阿尔兹海默病的表达及生物信息学分析
文献摘要：
目的:探究miR-182-5p在阿尔兹海默病(AD)病人血清中的表达水平,并采用生物信息学方法对其进行靶基因预测及功能分析.方法:从GEO数据库获取AD相关miRNAs芯片数据集GSE104514,利用GEO2R在线工具分析差异表达的miRNAs,选择差异最大的miR-182-5p进行深入研究.收集AD病人28例(AD组)及健康者15名(对照组),应用实时荧光定量聚合酶链反应法检测血清中miR-182-5p的表达水平.通过miRBase数据库分析miR-182-5p在不同物种间的保守性;运用miRcode、miRDB、miRWalk和Target Scan数据库预测miR-182-5p靶基因,并取交集靶基因;应用DAVID和KOBAS数据库对miR-182-5p靶基因进行GO功能及KEGG信号通路富集分析.结果:AD小鼠脑组织的miR-182-5p表达明显高于野生型小鼠(P<0.05),AD病人血清中的miR-182-5p表达量(2.022±1.225)明显高于对照组(0.486±0.442)(P<0.01);保守性分析显示miR-182-5p成熟体序列在不同物种间高度保守;在线数据库预测获得miR-182-5p潜在的交集靶基因共23个.GO富集结果显示,miR-182-5p靶基因主要参与于锌离子的结合、生物过程的负调控、杂环类化合物的结合、主要代谢过程的调节、GTPase的活性、膜的内在成分的组成、大脑的发育、部分细胞形态的发生、转移酶的活性、信号的调节、泛素结合酶的结合、耳蜗的发育、组蛋白H4-K16的乙酰化作用、咽系统的发育、神经元演化方向的规范、大脑皮层细胞的迁移、大脑皮层细胞的放射状定向迁移等多个生物学过程.KEGG分析结果显示,miR-182-5p靶基因主要参与肾集合管的酸分泌、醚脂类代谢、志贺菌病、细胞的黏附、细菌侵袭上皮细胞等5条信号通路.结论:miR-182-5p在AD病人血清中高表达,其可能通过多条信号通路参与AD的发展过程.
文献关键词：
阿尔兹海默病;miR-182-5p;生物信息学;靶基因
中图分类号：
作者姓名：
宋杨;于明
作者机构：
江苏大学附属医院 神经内科 ,江苏 镇江212000
文献出处：
引用格式：
[1]宋杨;于明-.miR-182-5p在阿尔兹海默病的表达及生物信息学分析)[J].蚌埠医学院学报,2022(12):1628-1632,1638
A类：
GSE104514
B类：
5p,阿尔兹海默病,生物信息学分析,AD,人血清,生物信息学方法,靶基因预测,功能分析,miRNAs,GEO2R,差异表达,选择差异,健康者,实时荧光定量聚合酶链反应,miRBase,数据库分析,种间,保守性,miRcode,miRDB,miRWalk,Target,Scan,交集,DAVID,KOBAS,信号通路富集,通路富集分析,小鼠脑组织,野生型,集结,锌离子,生物过程,负调控,类化合物,代谢过程,GTPase,细胞形态,转移酶,泛素结合酶,耳蜗,组蛋白,H4,K16,乙酰化作用,演化方向,大脑皮层,放射状,定向迁移,生物学过程,酸分泌,脂类代谢,志贺菌,上皮细胞,多条
AB值：
0.344608
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