典型文献
谷子CAD基因家族的鉴定及分析
文献摘要：
木质素类型、含量等与谷子茎秆的强度具有密切关系,肉桂醇脱氢酶(Cinnamyl Alcohol Dehydrogenase,CAD)是木质素生物合成过程中的一个关键酶.为探究谷子木质素合成过程中CAD基因家族的结构和功能,为CAD基因家族的进一步研究提供一定的参考,通过同源序列比对,在已知全基因组序列的xiaomi中共鉴定到13个SiCAD,分布于谷子1、2、4、6、7、9号染色体上.利用生物信息学方法对SiCAD基因家族成员进行亲缘关系、理化性质分析以及结构预测和表达谱分析.结果显示,SiCAD与狗尾草CAD的亲缘关系最近,且与豫谷1号CAD基因家族的同源性极高.13个SiCAD分属3个亚类,依次含有2、8、3个基因;结构预测结果显示,13个基因均为断裂基因,包含外显子数目为3～8个.表达谱分析结果表明,第1亚类基因SiCAD1具有时空表达差异性,在晋谷21号和xiaomi的茎中高表达,推测该基因编码谷子木质素生物合成的主要酶;第2亚类的SiCAD5和Si?CAD8在晋谷21号和xiaomi的茎中也高表达,该基因可能也是谷子重要的CAD基因;其余SiCAD的表达量相对较低或不表达.
文献关键词：
谷子;xiaomi;木质素;肉桂醇脱氢酶;基因家族;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
任晓庆;王波;欧阳春平;丁鑫炎;樊洁晶;高建华
作者机构：
山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 农学院/杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室,山西 太谷 030801
文献出处：
引用格式：
[1]任晓庆;王波;欧阳春平;丁鑫炎;樊洁晶;高建华-.谷子CAD基因家族的鉴定及分析)[J].山西农业科学,2022(03):289-295
A类：
Cinnamyl,xiaomi,SiCAD,SiCAD1,SiCAD5,CAD8
B类：
谷子,基因家族,木质素,茎秆,密切关系,肉桂醇脱氢酶,Alcohol,Dehydrogenase,生物合成,合成过程,关键酶,结构和功能,序列比对,全基因组序列,利用生物,生物信息学方法,亲缘关系,性质分析,结构预测,表达谱分析,狗尾草,同源性,分属,亚类,断裂基因,外显子,时空表达,表达差异,基因编码
AB值：
0.220188
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