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典型文献
地黄RgPR1基因的克隆、生物信息学及表达分析
文献摘要:
基于实验室前期获取的地黄转录组数据,设计了特异性引物,克隆了完整的RgPR1基因序列,通过生物信息学等方法对编码蛋白质进行了分析;利用荧光定量PCR方法分析了植物激素水杨酸和茉莉酸诱导下的RgPR1基因组织差异性表达.结果显示,RgPR1基因全长668 bp,共编码163个氨基酸,其编码的蛋白可能定位于细胞外,为不稳定的分泌蛋白.RgPR1蛋白与一串红的PR1蛋白的同源性最高;经水杨酸和茉莉酸处理后,PR1基因在地黄根、茎、叶中均显著提高,其中在叶中的表达量最高,根中次之,茎中的表达量最低.本研究成功克隆出RgPR1基因,发现其在不同组织中的表达具有一定的差异性,且外源水杨酸和茉莉酸对其表达具有调节作用,为进一步研究PR1基因在地黄抗病中的作用奠定了基础.
文献关键词:
地黄;PR1基因;基因克隆;生物信息学分析;表达分析
作者姓名:
牛乐;赵颖异;韩永光
作者机构:
河南中医药大学 药学院,河南 郑州 450046
文献出处:
引用格式:
[1]牛乐;赵颖异;韩永光-.地黄RgPR1基因的克隆、生物信息学及表达分析)[J].江西农业学报,2022(09):113-118
A类:
RgPR1
B类:
地黄,表达分析,转录组数据,特异性引物,基因序列,编码蛋白,植物激素,水杨酸和茉莉酸,组织差异性,差异性表达,全长,bp,分泌蛋白,一串红,同源性,经水,酸处理,不同组织,外源水杨酸,基因克隆,生物信息学分析
AB值:
0.233902
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