典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨淫羊藿抗肿瘤作用机制
文献摘要:
目的 通过网络药理学和分子对接方法探讨淫羊藿抗肿瘤的作用机制.方法 利用TCMSP数据库获取淫羊藿的活性成分以及相对应的靶点,利用Genecards、OMIM数据库获取疾病靶点,绘制药物-疾病韦恩图,获得其共同靶点;利用Cytoscape 3.8.2软件构建"淫羊藿活性成分-疾病靶点"网络可视化关系图;利用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白相互作用网络,并进行网络拓扑分析;利用R x644.0.5软件,对相关靶点进行GO和KEGG富集分析,了解淫羊藿抗肿瘤可能的生物过程及其通路;最后利用SYBYL 2.0软件分子对接进行半柔性对接反向验证.结果 筛选出淫羊藿活性成分23个,靶点193个;疾病相关靶点8169个,活性成分与疾病两者共同靶点173个;蛋白互作网络显示TP53、AKT1、JUN、CASP3等靶点基因在淫羊藿抗肿瘤的生物网络中起重要作用;潜在作用靶点涉及2592条生物学功能、176条通路.分子对接结果显示淫羊藿活性化合物与多个疾病关键靶点具有较高结合能力,对接评分较高的为淫羊藿苷与CASP3靶点蛋白.结论 淫羊藿抗肿瘤具有多靶点和多通路的潜在作用机制,为其进一步研究提供参考.
文献关键词:
抗肿瘤;淫羊藿;网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号:
作者姓名:
杨家军;原明月;牛野;陈杨春华;张会宗;袁子民
作者机构:
辽宁中医药大学药学院,辽宁 大连116600;辽宁中医药大学,辽宁 沈阳110847
文献出处:
引用格式:
[1]杨家军;原明月;牛野;陈杨春华;张会宗;袁子民-.基于网络药理学和分子对接探讨淫羊藿抗肿瘤作用机制)[J].药学研究,2022(05):292-298,306
A类:
x644
B类:
网络药理学,分子对接,抗肿瘤作用机制,对接方法,TCMSP,活性成分,Genecards,OMIM,制药,韦恩图,Cytoscape,软件构建,网络可视化,关系图,STRING,蛋白相互作用网络,网络拓扑分析,富集分析,生物过程,SYBYL,接进,反向验证,疾病相关,蛋白互作网络,TP53,AKT1,JUN,CASP3,靶点基因,生物网,潜在作用,作用靶点,生物学功能,活性化合物,关键靶点,结合能,淫羊藿苷,靶点蛋白,多靶点,多通路
AB值:
0.350545
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