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基于TMT定量蛋白质组学对白蛋白结合型紫杉醇所致周围神经病变的机制研究
文献摘要：
目的 基于串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)定量蛋白质组学技术探究白蛋白结合型紫杉醇(nab-paclitaxel,nab-PTX)导致周围神经病变的作用机制.方法 将6只雄性成年SD大鼠随机分为实验组与对照组,实验组大鼠分别于第1,3,5,7天腹腔注射白蛋白结合型紫杉醇(10 mg/kg体质量),建立周围神经病变大鼠模型,对照组大鼠不进行特殊干预继续正常培养,期间观察两组大鼠状态、饮食及粪便情况,并隔日称量体质量.末次给药48 h后取L4-6脊髓提取蛋白酶切后TMT标记.通过MaxQuant软件对TMT标记蛋白质进行鉴定及分析得出实验组与对照组的差异蛋白,对差异蛋白进行基因本体分析(gene ontology,GO)及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia ofGenes and Genomes,KEGG)富集分析.结果 蛋白质组学共鉴定蛋白5519种,对4730种蛋白进行定量分析,筛选出370种差异蛋白,如组蛋白H2B(histone H2B)、载脂蛋白D(apolipoprotein D)、激肽原-1(kininogen-1)和载脂蛋白E(apolipoprotein E)等.实验组与对照组相比,差异蛋白富集于细胞胞内,主要参与细胞过程、生物调节及刺激反应等生物过程,多数具有结合、催化活性等分子功能.KE GG通路富集分析显示差异蛋白主要富集于哮喘(asthma)、类固醇生物合成(steroid biosynthesis)、系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus)、Notch信号通路(Notch signaling pathway)等通路.结论 激肽原1(KNG1)、载脂蛋白E(ApoE)、丝氨酸棕榈酰转移酶(SPT)、肿瘤坏死因子α转化酶(TACE)等可能是nab-PTX作用的重要靶点,nab-PTX可能通过鞘脂代谢、Notch信号通路及叶酸生物合成等通路引起周围神经病变.
文献关键词：
周围神经病变;白蛋白结合型紫杉醇;蛋白质组学;KEGG通路分析;串联质谱标签
中图分类号：
作者姓名：
周雅卿;魏星;马莉;李维妙;单昌友;刘伟东;张淑群;赵永林
作者机构：
西安交通大学第二附属医院肿瘤科,西安 710004;西安交通大学第二附属医院妇产科;西安交通大学第二附属医院骨二科
文献出处：
引用格式：
[1]周雅卿;魏星;马莉;李维妙;单昌友;刘伟东;张淑群;赵永林-.基于TMT定量蛋白质组学对白蛋白结合型紫杉醇所致周围神经病变的机制研究)[J].山西医科大学学报,2022(09):1127-1132
A类：
nab,ofGenes,kininogen
B类：
TMT,定量蛋白质组学,白蛋白结合型紫杉醇,周围神经病变,串联质谱标签,tandem,mass,tag,蛋白质组学技术,技术探究,paclitaxel,PTX,腹腔注射,大鼠模型,特殊干预,粪便,隔日,称量,L4,脊髓,MaxQuant,差异蛋白,基因本体分析,gene,ontology,京都基因和基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genomes,种蛋,种差,组蛋白,H2B,histone,载脂蛋白,apolipoprotein,激肽原,刺激反应,生物过程,多数具,催化活性,通路富集分析,哮喘,asthma,类固醇,生物合成,steroid,biosynthesis,系统性红斑狼疮,systemic,lupus,erythematosus,Notch,signaling,pathway,KNG1,ApoE,丝氨酸,棕榈,转移酶,SPT,转化酶,TACE,鞘脂代谢,叶酸,通路分析
AB值：
0.309773
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