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典型文献
多组学技术在非小细胞肺癌脾虚湿滞证中的应用研究
文献摘要:
[目的]探讨非小细胞肺癌脾虚湿滞证肠道菌群、代谢组学和蛋白质组学的基本特征.[方法]选择非小细胞肺癌脾虚湿滞证患者13例作为患者组,健康志愿者15例作为对照组.收集两组粪便标本,运用16S核糖体DNA(16S ribosomal DNA,16S rDNA)鉴定技术检测肠道微生态,分析两组肠道菌群的多样性及差异性.采集两组血清标本,通过液相色谱-质谱联用技术对血清中的代谢物、蛋白进行检测,筛选差异明显的代谢物及蛋白,并进行富集分析通路预测.通过加权基因共表达网络分析(weighted correlation network analysis,WGCNA)软件对肠道菌群和代谢组学进行联合分析,阐明差异菌群-差异代谢物之间的关联性.通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行代谢组学和蛋白质组学数据联合分析,挖掘同一生物学进程中发生显著性变化的蛋白质和代谢物,探索肺癌关键基因和通路.[结果]两组间存在3种显著差异菌,分别是布鲁菌、鞘氨醇单胞菌、脱硫弧菌,14种差异蛋白(上调9个、下调5个),在补体和凝血信号通路(complement and coagulation cascades)、Pertussis、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositide 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)等通路上富集明显.13种差异代谢物(负离子模式下2个、正离子模式下11个),主要涉及卟啉和叶绿素代谢、不饱和脂肪酸的生物合成、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成等代谢通路.进一步通过联合分析发现,差异物质与丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、PI3K-Akt、Ras信号通路、癌症信号通路、细胞因子受体相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction)这5条信号通路相关.[结论]非小细胞肺癌脾虚湿滞证具有特异的肠道菌群、蛋白质和代谢物,通过联合分析发现PI3K-Akt、MAPK信号通路的失调可能与肺癌的发生发展相关.
文献关键词:
非小细胞肺癌;多组学技术;肠道菌群;蛋白质组学;代谢组学;脾虚湿滞证;联合分析;信号通路
作者姓名:
陈卓;马冠君;钱祥;傅晓璇;张爱琴
作者机构:
中国科学院大学附属肿瘤医院(浙江省肿瘤医院) 中国科学院基础医学与肿瘤研究所 杭州310022
引用格式:
[1]陈卓;马冠君;钱祥;傅晓璇;张爱琴-.多组学技术在非小细胞肺癌脾虚湿滞证中的应用研究)[J].浙江中医药大学学报,2022(01):12-22
A类:
脾虚湿滞证,Pertussis
B类:
多组学技术,非小细胞肺癌,肠道菌群,代谢组学,蛋白质组学,健康志愿者,粪便标本,16S,核糖体,ribosomal,rDNA,鉴定技术,肠道微生态,血清标本,联用技术,富集分析,加权基因共表达网络分析,weighted,correlation,network,analysis,WGCNA,联合分析,差异代谢物,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,组学数据,显著性变化,关键基因,布鲁菌,鞘氨醇单胞菌,脱硫弧菌,种差,差异蛋白,补体,complement,coagulation,cascades,磷脂酰肌醇,phosphatidylinositide,kinase,protein,PI3K,Akt,负离子,正离子模式,卟啉,叶绿素代谢,不饱和脂肪酸,生物合成,缬氨酸,异亮氨酸,代谢通路,异物,丝裂原活化蛋白激酶,mitogen,activated,MAPK,Ras,细胞因子受体,cytokine,receptor,interaction
AB值:
0.265146
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