典型文献
基于改进TF-IDF算法的基因通路富集方法
文献摘要：
提出一种综合考虑通路局部和全局信息的基因通路富集分析(GIGSEA)方法.首先利用基因相互作用数据,通过基因在通路的局部重要性和在通路数据库的全局特异性计算基因的影响力;然后将基因影响力和表型相关性值融合在一起,计算通路的富集分数;最后通过置换基因富集出统计学显著的通路.将GIGSEA方法运用于肝细胞癌和结肠直肠癌数据集进行风险通路富集,与基因集富集分析方法相比,GIGSEA方法能富集出一些新的相关通路,并排除无关的通路,提高疾病相关通路的富集效果.
文献关键词：
通路富集;基因影响力;基因集富集分析
中图分类号：
作者姓名：
徐淑坦;冷银辉;陈明
作者机构：
上海海洋大学信息学院,上海201306;农业农村部渔业信息重点实验室,上海201306
文献出处：
引用格式：
[1]徐淑坦;冷银辉;陈明-.基于改进TF-IDF算法的基因通路富集方法)[J].中国医学物理学杂志,2022(09):1173-1181
A类：
GIGSEA,基因影响力
B类：
TF,IDF,基因通路,富集方法,路局,全局信息,通路富集分析,路数,合在一起,基因富集,方法运用,肝细胞癌,结肠直肠癌,基因集富集分析,相关通路,并排,疾病相关
AB值：
0.288449
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