典型文献
采用SMRT测序技术考察莲子的真菌群落多样性
文献摘要：
目的 考察莲子中真菌群落的多样性.方法 采用单分子实时(SMRT)测序技术对莲子(红莲和白莲)中真菌的ITS全长扩增片段进行测序分析.通过评估测序数据、分析其α和β多样性,剖析真菌的组成、考察组间差异及菌属间的相关关系,剖析莲子的真菌群落结构.结果共检测到1界、10门、30纲、75目、158科、247属和342种真菌,优势菌为Botryosphae-ria wangensis(0～79.57％)、Lasiodiplodia laeliocattleyae(0.32％～49.18％)和 Colletotrichum aenigma(0～31.76％)和 Wallemia canadensis(0～22.86％).有潜在致病风险的真菌为 Colle-totrichum aenigma、Aspergillus vitricola、Rhizomucorpusillus,存在产毒风险的真菌为Fusarium pernambucanum.红莲和白莲样品的真菌组成在组间存在显著性差异,差异菌主要是Botryos-phaeria wangensis 和 Wallemia canadensis.结论 SMRT测序技术对研究莲子中真菌的多样性具有较好的适用性,并可通过分析产毒真菌的种类为莲子的安全使用提供风险预警.
文献关键词：
莲子;单分子实时测序(SMRT)技术;ITS全长序列;真菌群落;多样性
中图分类号：
作者姓名：
张寅;陈恒文;何轩辉
作者机构：
中国中医科学院广安门医院,北京 100053
文献出处：
引用格式：
[1]张寅;陈恒文;何轩辉-.采用SMRT测序技术考察莲子的真菌群落多样性)[J].中南药学,2022(11):2527-2532
A类：
Botryosphae,wangensis,laeliocattleyae,Colle,totrichum,vitricola,Rhizomucorpusillus,pernambucanum,Botryos,phaeria
B类：
SMRT,莲子,真菌群落多样性,红莲,白莲,ITS,全长,测序分析,估测,序数,考察组,属间,真菌群落结构,优势菌,Lasiodiplodia,Colletotrichum,aenigma,Wallemia,canadensis,致病风险,Aspergillus,Fusarium,析产,产毒真菌,安全使用,供风,风险预警,单分子实时测序
AB值：
0.294666
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