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肺腺癌患者差异甲基化区域分析
文献摘要：
目的 探讨DNA甲基化在肺腺癌发生中的作用机制.方法 收集2019年1月至12月新疆肿瘤医院确诊的肺腺癌和正常对照者外周血各4例,850K芯片甲基化检测平台检测肺腺癌组与正常对照组甲基化区域,Bump hunter寻找两组差异区域.Gene Ontology数据库和KOBAS软件对差异区域对应目的 基因进行GO分析和KEEG分析.结果 1.共筛选出DMR-1、DMR-2、DMR-3、DMR-4、DMR-6(以上位于chr6),DMR-5(位于chr11)和DMR-7(位于chr20)(P＜0.05)七组差异甲基化区域.DMR-1目的 基因为HLA-DPB1、HLA-DPA1,DMR-2的为POU5F1,DMR-3的为RP5-1186N24.3、SCAND3,DMR-4的为ZFP57,DMR-5的为LDHC,DMR-6的为LTA,DMR-7的为OXT.其中HLA-DPB1、HLA-DPA1等为高甲基化,SCANDS3和LTA为低甲基化.2.GO分析表明目的 基因主要在干扰素-γ、MHC-Ⅱ类复合物等功能中发挥重要作用.KEGG分析显示目的 基因甲基化主要在Ⅰ型糖尿病、NF-κB信号通路中高度富集.结论 1.肺腺癌患者DNA甲基化的状态可能是引起肺腺癌发生的关键因素,尤其是HLA-DP,POU5F1及LDHC的甲基化状态,在肺腺癌的发生中起着重要的作用.2.在GO功能和KEGG通路中,阐明了DNA甲基化异常导致疾病发展的作用机制.
文献关键词：
肺腺癌;DNA甲基化;目的基因;生信分析
中图分类号：
作者姓名：
李晓晗;曹国磊;牛海文;何丽丽;王清鹤;曹嘉芮;袁梦;阿丽亚·奥斯曼;李蕊;罗琴
作者机构：
830011 新疆乌鲁木齐,新疆医科大学第三临床医学院;830011新疆乌鲁木齐,新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸神经内科
文献出处：
引用格式：
[1]李晓晗;曹国磊;牛海文;何丽丽;王清鹤;曹嘉芮;袁梦;阿丽亚·奥斯曼;李蕊;罗琴-.肺腺癌患者差异甲基化区域分析)[J].临床肺科杂志,2022(01):68-73
A类：
chr20,1186N24,SCAND3,LDHC,SCANDS3
B类：
肺腺癌患者,区域分析,肿瘤医院,正常对照,850K,片甲,检测平台,平台检测,Bump,hunter,Gene,Ontology,KOBAS,KEEG,DMR,上位,chr6,chr11,HLA,DPB1,DPA1,POU5F1,RP5,ZFP57,LTA,OXT,高甲基化,明目,干扰素,MHC,复合物,基因甲基化,甲基化状态,常导,疾病发展,目的基因,生信分析
AB值：
0.338538
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