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基于生物信息学及分子对接技术探究清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制
文献摘要：
目的 应用生物信息学及分子对接技术探究清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制.方法 通过NCBI GEO数据库获取骨关节炎相关芯片,采用R语言进行差异基因表达分析.应用GeneCards数据库对骨关节炎靶基因进行检索与筛选,对骨关节炎疾病靶基因进行预测.应用TCMSP数据库对黄柏、苍术、桃仁、红花的主要有效成分及作用靶基因进行筛选和挖掘,构建药物与疾病映射靶基因的PPI网络,通过David数据库对关键靶基因进行GO生物过程及KEGG通路富集分析.最终将中药主要有效成分与关联度较高的关键靶基因进行分子对接.结果 中药有效成分-靶基因网络图包含86个有效成分,相对应靶点40个;筛选得到差异表达基因136个,其中上调基因61个,下调基因75个;通过疾病数据库检索并与差异基因合并去重后得到与骨关节炎相关的疾病靶基因628个;获得映射靶基因40个,关键靶基因10个.关键靶点IL6、TNF、PTGS2、MAPK14、MPO富集作用于TNF信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、GnRH信号通路、Estrogen信号通路、T细胞受体信号通路等多个经典信号通路,主要涉及一氧化氮生物合成过程的正调控、平滑肌细胞增殖的正调控、细胞对脂多糖的反应、血管生成、对糖皮质激素的反应等多个生物过程.关联度较高的主要有效成分在与关键靶基因对接过程中均进入了活性位点,具有很强的结合能力.结论 应用生物信息学和分子对接技术,可揭示清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制,为骨关节炎的治疗提供了新的思路和方法.
文献关键词：
骨关节炎;生物信息学;网络药理学;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
潘浩;王桂香;刘琳琳;刘丹;王峰;季文辉;刘国强
作者机构：
河北省沧州中西医结合医院,河北 沧州061000
文献出处：
引用格式：
[1]潘浩;王桂香;刘琳琳;刘丹;王峰;季文辉;刘国强-.基于生物信息学及分子对接技术探究清热利湿与活血化瘀类中药配伍干预骨关节炎的分子机制)[J].实用药物与临床,2022(04):307-312
A类：
B类：
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AB值：
0.26048
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