典型文献
基于铁死亡相关基因的口腔鳞状细胞癌的生物信息学分析
文献摘要:
目的:探究铁死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌(OSCC)发生发展中的作用,初步确定潜在生物标志物.方法:从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载头颈部鳞状细胞癌相关临床数据并筛选得到OSCC相关数据.利用R软件筛选差异表达的铁死亡相关基因并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析.利用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络并利用R软件筛选关键基因.对关键基因进行Kaplan-Meier生存曲线绘制和Cox回归分析.结果:共筛选出44个铁死亡相关差异表达基因,进一步分析发现9个关键基因,其中IFNG和EGFR在OSCC组织中的表达水平与生存率显著相关(P<0.05).结论:铁死亡相关基因IFNG和EGFR可作为口腔鳞状细胞癌患者预后潜在的标志物.
文献关键词:
口腔鳞状细胞癌;铁死亡;生物信息学;差异表达;GO富集;KEGG富集;蛋白质相互作用
中图分类号:
作者姓名:
晏子钦;魏明波;程波
作者机构:
武汉大学中南医院口腔科 湖北 武汉 430071
文献出处:
引用格式:
[1]晏子钦;魏明波;程波-.基于铁死亡相关基因的口腔鳞状细胞癌的生物信息学分析)[J].临床口腔医学杂志,2022(01):19-22
A类:
B类:
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AB值:
0.230456
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