典型文献
基于单细胞测序技术探讨肠上皮细胞在溃疡性结肠炎中的功能变化
文献摘要：
目的:基于单细胞测序技术挖掘溃疡性结肠炎(UC)结肠黏膜单细胞测序数据,探讨肠上皮细胞在UC中的功能变化.方法:下载基因表达综合(GEO)数据集(GSE150115),分析该数据集中5例UC患者肠黏膜组织10 X Genomics单细胞转录组测序数据,进行细胞亚群分类、肠上皮细胞识别、细胞间差异基因筛选、基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.结果:从10个细胞亚群中识别出cluster 5为肠上皮细胞,并筛选出细胞间差异基因.GO功能富集分析发现,在肠上皮细胞中显著差异基因包括PI3、IgG-Fc段结合蛋白(FCGBP)、紧密连接蛋白4(CLDN4)等,其差异基因主要富集于核苷酸代谢;KEGG信号通路富集分析发现,差异基因主要参与神经系统疾病.结论:肠上皮细胞的核苷酸代谢异常可能参与UC发病,同时可能增加神经系统疾病的发生风险.
文献关键词：
溃疡性结肠炎(UC);单细胞测序;肠上皮细胞;核苷酸代谢;神经系统疾病
中图分类号：
作者姓名：
沈鹏;谢睿;马天恒;吴尚农;戴伟杰;王宏刚
作者机构：
南京医科大学附属淮安第一医院消化内科 江苏淮安 223300
文献出处：
引用格式：
[1]沈鹏;谢睿;马天恒;吴尚农;戴伟杰;王宏刚-.基于单细胞测序技术探讨肠上皮细胞在溃疡性结肠炎中的功能变化)[J].中国医学装备,2022(08):28-32
A类：
GSE150115
B类：
单细胞测序技术,技术探讨,肠上皮细胞,溃疡性结肠炎,UC,序数,下载,GEO,肠黏膜组织,Genomics,单细胞转录组测序,细胞亚群,差异基因筛选,基因本体,京都基因与基因组百科全书,信号通路富集,通路富集分析,cluster,功能富集分析,PI3,IgG,Fc,结合蛋白,FCGBP,紧密连接蛋白,CLDN4,核苷酸代谢,神经系统疾病,代谢异常,发生风险
AB值：
0.215274
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