典型文献
SIM2基因在膀胱癌组织中的表达及临床意义
文献摘要：
目的 利用在线生物信息数据库,组织和细胞水平实验探究SIM2基因在膀胱癌中的表达及涉及的临床意义.方法 通过UALCAN数据库分析SIM2基因在膀胱癌患者和正常膀胱组织中的表达差异,SIM2基因表达与膀胱癌患者淋巴结转移、分期、组织亚型等临床病理参数的关系;GEPIA数据库、HPA数据库、组织芯片和定量PCR技术验证SIM2基因在膀胱癌患者中的mRNA和蛋白表达差异;利用String数据库分析SIM2基因的蛋白相互作用及调控网络;Linked Omics数据库做SIM2相关分子的富集分析;TIMER和TISIDB数据库分析SIM2基因与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系.结果 UALCAN、GEPIA和HPA数据库结果显示,膀胱癌组织中SIM2基因的mRNA和蛋白水平的表达明显高于正常膀胱组织(P<0.05);UALCAN在线工具分析揭示,SIM2的表达与患者的淋巴结转移、病理类型、分期密切相关;免疫组织化学及定量PCR湿实验结果显示,SIM2蛋白和mRNA表达水平在膀胱癌组织中明显升高(P<0.05),但SIM2的表达与膀胱癌患者TNM分期和病理分级无相关性;String在线分析结果提示,与SIM2具有相互作用的蛋白涉及生物过程包括参与类泛素蛋白修饰、转录调控、蛋白水解等生物学过程;LinkedOmics富集分析表明,与SIM2正相关基因涉及TNF、NF-kappa B和JAK-STA等信号通路及多种生物学功能,包括细胞黏附分子结合,G蛋白偶联受体结合和细胞因子受体活性等;免疫细胞浸润水平显示SIM2的表达与树突状细胞等呈负相关.结论 通过在多种在线数据库及实验结果揭示SIM2基因在膀胱癌中高表达,可能为膀胱癌发生发展的重要分子靶点.
文献关键词：
SIM2;膀胱癌;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
杜红飞;袁鸿玲;李臻玥;许颖
作者机构：
成都医学院第一附属医院检验科,四川成都610500
文献出处：
引用格式：
[1]杜红飞;袁鸿玲;李臻玥;许颖-.SIM2基因在膀胱癌组织中的表达及临床意义)[J].四川医学,2022(10):985-992
A类：
B类：
SIM2,癌组织,生物信息数据库,平实,实验探究,UALCAN,数据库分析,膀胱癌患者,表达差异,淋巴结转移,临床病理参数,GEPIA,HPA,组织芯片,技术验证,String,蛋白相互作用,调控网络,富集分析,TIMER,TISIDB,肿瘤微环境,免疫细胞浸润,病理类型,免疫组织化学,TNM,病理分级,无相,在线分析,生物过程,类泛素蛋白,蛋白修饰,转录调控,蛋白水解,生物学过程,LinkedOmics,kappa,JAK,STA,生物学功能,细胞黏附分子,分子结,偶联,细胞因子受体,树突状细胞,分子靶点
AB值：
0.254641
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