典型文献
扩张型心肌病核心基因及其免疫浸润生物信息学分析
文献摘要:
目的 利用生物信息学分析筛选扩张型心肌病(DCM)发生的相关核心基因并分析其免疫细胞浸润情况.方法 从GEO数据库中下载基因芯片数据集,利用多种算法分析差异表达基因,进行功能富集,构建加权共表达网络及蛋白互作网络,鉴定核心基因,挖掘免疫细胞的浸润情况,并利用外部数据集验证核心基因的诊断效能.结果 共筛选出35个差异基因和包含114个基因的核心模块.其中,F13A1、VSIG4、CD163、RNASE2及LYVE1被鉴定为核心基因.DCM组织与健康心肌中的记忆B细胞、浆细胞、Tregs细胞、活化NK细胞、M2型巨噬细胞及中性粒细胞的含量具有统计学意义.结论 筛选出的5个核心基因和6种免疫细胞可能参与了DCM的发生发展.
文献关键词:
扩张型心肌病;生物信息学;核心基因;免疫浸润
中图分类号:
作者姓名:
张清泉;吴春宇;范勐慷;潘海燕;潘闽
作者机构:
南通大学附属医院心内科,江苏省南通市226001
文献出处:
引用格式:
[1]张清泉;吴春宇;范勐慷;潘海燕;潘闽-.扩张型心肌病核心基因及其免疫浸润生物信息学分析)[J].中南医学科学杂志,2022(02):202-205
A类:
RNASE2,LYVE1
B类:
扩张型心肌病,核心基因,免疫浸润,生物信息学分析,利用生物,DCM,免疫细胞浸润,GEO,下载,基因芯片,算法分析,差异表达基因,功能富集,加权共表达网络,蛋白互作网络,外部数据,数据集验证,诊断效能,差异基因,核心模块,F13A1,VSIG4,CD163,浆细胞,Tregs,NK,M2,巨噬细胞
AB值:
0.319832
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