典型文献
基于网络药理学与生物信息学探讨《古今录验》续命汤对急性脑梗死的作用机制
文献摘要：
目的 采用网络药理学和生物信息学方法探讨《古今录验》续命汤治疗急性脑梗死的作用机制,为其临床应用提供依据.方法 通过TCMSP、中医药整合药理学研究平台v2.0(TCMIP)、PubChem、ChemSpider、SwissTargetPrediction、GEO、miRDB、miRTarBasead、TargetScan数据库获取和挖掘《古今录验》续命汤的活性成分、预测靶点及急性脑梗死的差异表达长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)、信使RNA(mRNA),利用R软件ggalluvial包绘制竞争性内源RNA(ceRNA)网络.将得到的差异miRNA采用TransmiR v2.0数据库预测转录因子,采用ggplot2包对转录因子与药物作用靶点取交集.使用Cytoscape3.8.0软件及其插件Cytohubba与STRING数据库构建活性成分-关键转录因子网络、蛋白相互作用网络,并进行核心基因筛选.运用R语言Biomanager、ClusterProfiler包进行关键转录因子GO功能及KEGG通路富集分析,最后予以分子对接评估.结果 收集并筛选出《古今录验》续命汤活性成分57个,潜在作用靶点816个,急性脑梗死差异lncRNA 48个,构建了由16个关键lncRNAs、16个关键miRNAs和17个关键mRNAs组成的ceRNA转录网络.通过差异miRNA预测出294个转录因子,与《古今录验》续命汤活性成分作用靶点取交集后得到关键转录因子43个.富集分析结果显示,这些靶基因参与了急性脑梗死的自噬、氧化应激、炎症反应、凋亡等病理生理过程,主要通过IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路发挥作用.结论 《古今录验》续命汤可能通过调控IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等,靶向调控急性脑梗死的自噬、氧化应激、炎症反应、凋亡等病理过程.
文献关键词：
《古今录验》续命汤;急性脑梗死;竞争性内源RNA;转录因子;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
蔡昱哲;彭珣;李钰佳;彭岚玉;刘艺璇;刘迅;邓奕辉
作者机构：
湖南中医药大学,湖南 长沙 410208
文献出处：
引用格式：
[1]蔡昱哲;彭珣;李钰佳;彭岚玉;刘艺璇;刘迅;邓奕辉-.基于网络药理学与生物信息学探讨《古今录验》续命汤对急性脑梗死的作用机制)[J].中国中医药信息杂志,2022(04):13-20
A类：
miRTarBasead,ggalluvial,Biomanager
B类：
网络药理学,续命汤,急性脑梗死,生物信息学方法,TCMSP,整合药理学,药理学研究,研究平台,v2,TCMIP,PubChem,ChemSpider,SwissTargetPrediction,GEO,miRDB,TargetScan,活性成分,差异表达,长链非编码,信使,竞争性,ceRNA,TransmiR,ggplot2,药物作用靶点,交集,Cytoscape3,插件,Cytohubba,STRING,数据库构建,关键转录因子,子网络,蛋白相互作用网络,核心基因,基因筛选,ClusterProfiler,通路富集分析,分子对接,潜在作用,lncRNAs,miRNAs,mRNAs,预测出,成分作用,靶基因,自噬,病理生理,生理过程,PI3K,Akt,HIF,靶向调控,病理过程
AB值：
0.288666
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