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腐生性钩端螺旋体Potoc菌株全基因组学分析
文献摘要：
目的 了解腐生性钩端螺旋体(简称钩体)Potoc菌株的全基因组分子特征.方法 将腐生性钩体Potoc菌株培养后,应用高通量测序技术进行全基因组序列测定和比较基因组学分析,并将Potoc菌株灭活菌液与国内15种不同血清群致病性钩体代表菌株的兔血清进行免疫印迹分析.结果 腐生性钩体Potoc菌株全基因组序列全长为3942789 bp,共含有编码基因3685个,其中具有直系同源簇功能2052个,其平均GC含量为39.0％.比较基因组学分析发现Potoc菌株与国外已发表的腐生性钩体Ames菌株基因组核苷酸一致性高,同时也证实其基因组中并不存在O抗原生物合成基因簇(rfb)序列或类似基因.与问号基因种、波氏基因种和中间型L.licerasiae菌株存在共有基因1110个,而Potoc菌株基因组中所含有特有的基因共计2278个.免疫印迹分析结果发现Potoc菌株与致病性钩体中存在种属特异性的蛋白抗原成分.此外,基于全基因组水平的系统发育进化树显示,不同致病性钩体分为不同进化分支,具有特定进化历程.结论 获得了腐生性钩体Potoc菌株基因组的基本特征,探究了钩体属特异性抗原,揭示了不同基因种钩体基因组多样性,为后续致病性钩体的诊断和进化等研究奠定一定基础.
文献关键词：
腐生性钩端螺旋体;Potoc菌株;全基因组序列;诊断
中图分类号：
作者姓名：
张影;石刚;李彬;杜宗利;辛晓芳;徐颖华
作者机构：
102629 北京,中国食品药品检定研究院国家卫生健康委员会生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室
文献出处：
引用格式：
[1]张影;石刚;李彬;杜宗利;辛晓芳;徐颖华-.腐生性钩端螺旋体Potoc菌株全基因组学分析)[J].中国医药生物技术,2022(06):497-502
A类：
腐生性钩端螺旋体,Potoc,rfb,licerasiae
B类：
全基因组学分析,分子特征,高通量测序技术,全基因组序列,序列测定,比较基因组学分析,灭活菌,菌液,血清群,致病性钩体,免疫印迹分析,全长,bp,编码基因,直系,Ames,生物合成基因簇,问号,基因种,中间型,所含,种属,系统发育进化树,进化分支
AB值：
0.160728
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