典型文献
不同海拔喜马拉雅旱獭线粒体基因组比较分析
文献摘要：
以分布在不同海拔(2279、3273、4452 m)的喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)为供试材料,通过二代测序技术对线粒体基因组序列进行比较分析,挖掘喜马拉雅旱獭低氧适应相关基因.结果表明:不同海拔喜马拉雅旱獭线粒体序列长度之间并无差异,但蛋白质编码基因突变位点个数随海拔增加而增多,ND5基因的突变位点个数和非同义突变位点个数都为最多,其Ka/Ks>1,表明ND5基因存在正选择效应,可作为适应高海拔低氧环境的候选基因.与玉树(海拔4452 m)相比,乐都(海拔2279 m)和黄南(海拔3273 m)的喜马拉雅旱獭亲缘关系相对较近.喜马拉雅旱獭13个蛋白质编码基因的核苷酸序列共编码氨基酸3812个,去掉起始密码子和终止密码子后共编码氨基酸3802个.在20种氨基酸中,Leu的使用率最高,达16.18％,Gys的使用率最低,仅有0.71％.RSCU值>1的密码子有32种,RSCU值<1的密码子有32种,其中AGG的RSCU为0.
文献关键词：
喜马拉雅旱獭;线粒体基因组;ND5;Ka/Ks
中图分类号：
作者姓名：
南新营;李优;李耀东
作者机构：
青海大学, 西宁, 810016
文献出处：
引用格式：
[1]南新营;李优;李耀东-.不同海拔喜马拉雅旱獭线粒体基因组比较分析)[J].野生动物学报,2022(02):345-353
A类：
Gys
B类：
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AB值：
0.245538
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