典型文献
房山紫堇叶绿体基因组特征及其系统进化关系
文献摘要:
房山紫堇(Corydalis f angshanensis W.T.Wang ex S.Y.He)是罂粟科紫堇属植物,根具有清热解毒的功效,也可用于防风固沙,保持水土.为探究房山紫堇的叶绿体基因组特征及其系统进化关系,利用高通量测序技术对房山紫堇叶绿体基因组进行测序和功能注释,并对其进行分析,利用M EGA7构建系统发育树.结果显示:房山紫堇的叶绿体基因组为191128 bp,GC含量为40.2%;共注释127个基因,包括84个蛋白质编码基因(66.1%)、35个tRNA基因(27.6%)以及8个rRNA基因(6.3%);叶绿体基因组的密码子偏好性较弱;叶绿体基因组的GC3 s含量为38.5%,GC含量也小于50%,密码子偏向使用A和T这两种碱基;多重比较分析结果显示,紫堇属植物的编码区较为保守;系统发育分析表明,房山紫堇与紫堇的亲缘关系最近.研究房山紫堇叶绿体基因组及其进化关系有助于探索紫堇属植物的分类与进化,并可促进房山紫堇的开发和利用.
文献关键词:
房山紫堇;叶绿体基因组;系统发育分析
中图分类号:
作者姓名:
孙哲;李澳旋;杜晓蓉;宋芸;乔永刚
作者机构:
山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801;中兽医药现代化山西省重点实验室,山西太谷030801
文献出处:
引用格式:
[1]孙哲;李澳旋;杜晓蓉;宋芸;乔永刚-.房山紫堇叶绿体基因组特征及其系统进化关系)[J].草地学报,2022(08):1982-1989
A类:
房山紫堇,angshanensis,EGA7
B类:
叶绿体基因组,基因组特征,系统进化,进化关系,Corydalis,Wang,ex,He,罂粟科,紫堇属,清热解毒,防风固沙,持水,高通量测序技术,功能注释,建系,系统发育树,bp,蛋白质编码基因,tRNA,rRNA,密码子偏好性,GC3,碱基,多重比较,编码区,系统发育分析,亲缘关系,开发和利用
AB值:
0.187024
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