典型文献
基于iTRAQ-PRM技术筛选不同类型土壤烤烟根系差异表达蛋白
文献摘要：
[目的]从蛋白质水平揭示烤烟根系对不同类型土壤的响应差异.[方法]以烤烟品种K326为材料,选取石灰岩土(沙壤土)、水稻土和红壤土,测定3种类型土壤烤烟根系活力、硝酸还原酶(NR)、谷氨酰胺合成酶(GS)和天冬氨酸合成酶(AS)活性;利用iTRAQ技术鉴定3种类型土壤烤烟根系差异表达蛋白,对所获得的差异蛋白进行生物信息学分析,从中选择16个蛋白进行平行反应监测(PRM)验证.[结果](1)红壤土的烤烟根系活力、NR、GS和AS活性均高于沙壤土和水稻土;(2)从水稻土vs沙壤土、沙壤土vs红壤土、水稻土vs红壤土3组对比中分别鉴定出699、650、569个烤烟根系差异表达蛋白,其中上调/下调蛋白分别为412/287、291/359和323/246个;(3)差异蛋白质主要有催化、结合、转运活性等功能;(4)差异蛋白功能富集于次生代谢产物的生物合成、代谢途径和苯丙烷类生物合成等代谢途径;(5)红壤土烤烟根系与抗逆性、碳水化合物和能量代谢、蛋白质合成等相关的差异蛋白表达均高于沙壤土和水稻土.[结论]利用iTRAQ标记技术,结合PRM验证技术筛选出不同类型土壤烤烟根系差异表达蛋白,为获取响应关键蛋白奠定基础.
文献关键词：
iTRAQ;烟草根系;土壤类型;氮代谢;蛋白质组学
中图分类号：
作者姓名：
杨睿;查文菊;陈颐;何承刚;王涛;何聪莲;费明亮
作者机构：
云南省烟草农业科学研究院,云南省昆明市五华区圆通街33号 650031;云南农业大学,云南省昆明市盘龙区沣源路452号 650201;云南省烟草公司曲靖市公司,云南省曲靖市官坡巷51号 671000
文献出处：
引用格式：
[1]杨睿;查文菊;陈颐;何承刚;王涛;何聪莲;费明亮-.基于iTRAQ-PRM技术筛选不同类型土壤烤烟根系差异表达蛋白)[J].中国烟草学报,2022(01):86-97
A类：
B类：
iTRAQ,PRM,技术筛选,差异表达蛋白,蛋白质水平,响应差异,烤烟品种,K326,取石,石灰岩,岩土,水稻土,红壤土,根系活力,硝酸还原酶,NR,谷氨酰胺合成酶,GS,天冬氨酸,AS,技术鉴定,生物信息学分析,平行反应监测,差异蛋白质,转运活性,蛋白功能,功能富集,次生代谢产物,生物合成,代谢途径,苯丙烷,类生物,抗逆性,碳水化合物,能量代谢,蛋白质合成,差异蛋白表达,标记技术,验证技术,关键蛋白,烟草根系,土壤类型,氮代谢,蛋白质组学
AB值：
0.291771
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
