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Rheinheimera sp.QH胞外角蛋白酶KerQH2的生物信息学分析
文献摘要：
目的:预测海洋菌Rheinheimera sp.QH分泌的角蛋白酶KerQH2的结构特征及与底物的互作位点,为深入研究KerQH2对角蛋白底物的降解机理提供理论依据.方法:应用生物信息学技术对KerQH2的结构特征、作用于角蛋白底物的可能位点及关键氨基酸等进行分析.结果:KerQH2为S8家族丝氨酸蛋白酶,其分子表面无规则卷曲占比较高,α-螺旋与β-折叠占比较低且多位于酶分子内部.KerQH2具有保守的催化三联体(Asp8、His41和Ser197),催化三联体区域表面静电势为中性.KerQH2催化结构域中含有大量保守的极性氨基酸及芳香族氨基酸,与底物结合有关的序列富含Gly和Ala.KerQH2主要切割疏水性氨基酸Val(V)/ILe(I)和极性氨基酸Cys(C)/Gln(Q)之间形成的肽键.结论:角蛋白酶KerQH2的特殊结构有助于其降解结构复杂角蛋白分子,这可能是海洋菌对海洋寡营养环境的一种适应性.
文献关键词：
角蛋白酶;KerQH2;海洋菌;Rheinheimera sp.;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
栗学清;庞鑫;高慧芳;张廉芸;宋英达;武翠玲
作者机构：
长治医学院基础医学部生物化学与分子生物学教研室,山西长治 046000;长治医学院精神卫生系,山西长治 046000;长治医学院临床医学系,山西长治 046000
文献出处：
引用格式：
[1]栗学清;庞鑫;高慧芳;张廉芸;宋英达;武翠玲-.Rheinheimera sp.QH胞外角蛋白酶KerQH2的生物信息学分析)[J].食品工业科技,2022(09):125-130
A类：
KerQH2,Asp8,His41,Ser197,ILe
B类：
Rheinheimera,外角,角蛋白酶,生物信息学分析,测海,海洋菌,底物,对角,白底,降解机理,生物信息学技术,S8,丝氨酸蛋白酶,面无,无规则,卷曲,折叠,三联体,表面静电势,催化结构域,芳香族氨基酸,Gly,Ala,疏水性,Val,Cys,Gln,肽键,特殊结构,解结,营养环境
AB值：
0.269347
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