典型文献
陆地棉AGPase基因家族的鉴定及表达分析
文献摘要：
[目的]腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(adenosine diphosphate-glucose pyrophosphorylase,AGPase)是淀粉生物合成途径的限速酶,在植物"源"、"库"器官淀粉的合成与积累过程中扮演着重要角色,然而棉花中AGPase基因家族的系统研究工作尚未开展.[方法]基于已公布的陆地棉标准系TM-1基因组数据,利用生物信息学方法对陆地棉AGPase基因家族进行全基因组鉴定,并对该家族成员的理化性质、系统进化关系、基因结构、启动子区顺式作用元件进行分析.利用转录组数据和实时荧光定量聚合酶链式反应分析AGPase家族基因的组织表达特性和在非生物胁迫下的表达模式.[结果]在陆地棉基因组中,共鉴定到20个AGPase基因(GhAGP),不均匀地分布在16条染色体上.GhAGP基因包含12个大亚基基因和8个小亚基基因共2类,同一类GhAGP基因具有相似的保守基序和外显子-内含子结构.GhAGP基因启动子区含有多个与植物激素、非生物胁迫响应相关的顺式作用元件.组织表达分析结果显示,GhAGP基因具有不同的组织表达模式.非生物胁迫下的表达分析表明,多数GhAGP基因响应低温、高温、盐和干旱胁迫诱导表达,其中GhAGPL1和GhAGPL7参与棉花对多种逆境胁迫的响应.[结论]明确了陆地棉AGPase基因家族成员的分布特征、结构特征以及系统进化特征,初步揭示了该家族基因在棉花响应外界环境胁迫中的功能,可为棉花淀粉性状的遗传改良和抗逆育种提供重要的候选基因资源.
文献关键词：
腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase);基因家族;非生物胁迫;表达模式;陆地棉
中图分类号：
作者姓名：
晁毛妮;董洁;胡根海;黄玲;张金宝;付远志;王清连
作者机构：
河南科技学院/现代生物育种河南省协同创新中心/河南省棉麦分子生态与种质创新重点实验室,河南 新乡453003;山东农业大学农学院,山东 泰安271018
文献出处：
引用格式：
[1]晁毛妮;董洁;胡根海;黄玲;张金宝;付远志;王清连-.陆地棉AGPase基因家族的鉴定及表达分析)[J].棉花学报,2022(04):299-312
A类：
GhAGP,GhAGPL1,GhAGPL7
B类：
AGPase,基因家族,腺苷,二磷酸,酸葡萄,焦磷酸,磷酸化酶,adenosine,diphosphate,glucose,pyrophosphorylase,淀粉生物合成,生物合成途径,限速酶,积累过程,棉花,TM,基因组数据,利用生物,生物信息学方法,全基因组鉴定,系统进化,进化关系,基因结构,顺式作用元件,转录组数据,实时荧光定量聚合酶链式反应,家族基因,组织表达特性,非生物胁迫,陆地棉基因组,亚基,保守基序,外显子,内含子,基因启动子区,植物激素,胁迫响应,组织表达分析,组织表达模式,干旱胁迫,诱导表达,逆境胁迫,进化特征,外界环境,环境胁迫,遗传改良,抗逆,育种,候选基因,基因资源
AB值：
0.275009
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
