典型文献
希金斯炭疽菌中NPFxD基序蛋白找寻及其生物信息学分析
文献摘要：
希金斯炭疽菌是一种半活体营养型植物炭疽病原真菌,能够侵染多种十字花科植物引起的炭疽病,特别是引起蔬菜炭疽病的重要病原.胞吞在真菌侵染植物过程中发挥着重要作用,该作用一般同具有NPFxD基序的蛋白受体介导有关,然而,目前有关该炭疽菌中胞吞作用相关蛋白尚未明确.基于前人已报道的构巢曲霉中NPFxD蛋白序列,通过关键词搜索以及Blastp比对等方法对希金斯炭疽菌蛋白质数据库进行NPFxD蛋白找寻,明确该菌中存在2个NPFxD蛋白序列,根据蛋白同源性,分别命名为ChMYO1、ChGBP2.同时,对这2个蛋白序列开展了保守结构域及跨膜区结构、蛋白质理化性、信号肽、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析.结果表明,ChMYO1、ChGBP2蛋白亚细胞定位情况不同,前者定位在质膜,后者定位在核内;两者在亲疏水性、最高氨基酸残基和其位置等均有着一定差异;两者均无明显的信号肽序列;两者均含有无规则卷曲、α螺旋、β卷曲,而缺乏TM螺旋.此外,对多个不同真菌中NPFxD基序同源蛋白序列开展遗传关系分析,明确希金斯炭疽菌中的NPFxD基序蛋白与炭疽菌属中其他病菌中的蛋白具有较高的同源性,本研究为进一步研究炭疽菌属NPFxD基序蛋白的功能提供了理论参考.
文献关键词：
胞吞作用;希金斯炭疽菌;NPFxD基序蛋白;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
陈光建;覃悦;韩长志
作者机构：
西南林业大学生物多样性保护学院,云南昆明650224;西南林业大学研究生院,云南昆明650224;云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明650224
文献出处：
引用格式：
[1]陈光建;覃悦;韩长志-.希金斯炭疽菌中NPFxD基序蛋白找寻及其生物信息学分析)[J].江苏农业科学,2022(05):35-40
A类：
希金斯炭疽菌,NPFxD,ChMYO1,ChGBP2
B类：
基序,找寻,生物信息学分析,活体,营养型,炭疽病,病原真菌,侵染,十字花科,胞吞作用,构巢曲霉,过关,关键词搜索,Blastp,蛋白质数据库,同源性,保守结构域,信号肽,二级结构,蛋白亚细胞定位,质膜,亲疏水性,氨基酸残基,肽序列,无规则,卷曲,TM,同源蛋白,遗传关系,关系分析,炭疽菌属
AB值：
0.200503
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