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典型文献
青花菜Whirly基因的克隆、系统进化及表达特征分析
文献摘要:
[目的]克隆青花菜Whirly基因,并分析其序列特征和表达模式,为进一步深入研究其渍水胁迫响应机制及其生物学功能奠定基础.[方法]以"KU20-7"为材料,利用RT-PCR技术克隆得到青花菜Whirly基因,并对其分子量、等电点和二级结构进行分析.利用软件MEGA 6.0对部分植物代表种的Whirly蛋白进行序列比对,而后构建系统进化树.[结果]从青花菜中克隆到Whir-ly基因家族的3个成员,命名为BoWHY1、BoWHY2和BoWHY3,其基因长度分别为795、723和783 bp,推导分别编码264、240和260个氨基酸.系统进化分析表明,低等植物(藻类、苔藓和裸子植物)Whirly 成员位于进化树的底端,被子植物Whirly成员则聚为1个大组.被子植物中乌油樟、葡萄、杨树和木瓜相对独立,挑选的十字花科物种则聚在一起.青花菜BoWHY2与BoWHY1/BoWHY3的亲缘关系相对较远.qRT-PCR分析显示,在渍水胁迫下BoWHY1的表达量随胁迫时间的延长逐渐递减.BoWHY2和BoWHY3的表达量呈现出先上升(2 d)后下降(6 d)的趋势,且BoWHY2的响应更加剧烈.[结论]植物Whirly基因家族可能由一个祖先基因进化而来.在长期进化过程中青花菜旁系同源基因BoWHY1和BoWHY3可能发生了亚功能化,渍水胁迫的表达特征也印证了此观点.
文献关键词:
青花菜;Whirly;系统进化;渍水胁迫;表达特征
作者姓名:
荆赞革;裴徐梨;李成慧;唐征;冯鹏宇
作者机构:
昆明学院农学与生命科学学院,昆明 650214;温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州 325006
文献出处:
引用格式:
[1]荆赞革;裴徐梨;李成慧;唐征;冯鹏宇-.青花菜Whirly基因的克隆、系统进化及表达特征分析)[J].西南农业学报,2022(12):2719-2723
A类:
Whirly,KU20,Whir,BoWHY1,BoWHY2,BoWHY3
B类:
青花菜,表达特征,序列特征,表达模式,渍水胁迫,胁迫响应,响应机制,生物学功能,分子量,等电点,二级结构,利用软件,MEGA,序列比对,建系,系统进化树,基因家族,bp,分别编,系统进化分析,低等植物,藻类,苔藓,裸子植物,底端,被子植物,油樟,杨树,木瓜,十字花科,聚在一起,亲缘关系,较远,qRT,先上,祖先,基因进化,中青,旁系,同源基因,功能化
AB值:
0.236624
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