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典型文献
闽楠PLR基因家族鉴定及响应激素的表达分析
文献摘要:
[目的]解析闽楠Phoebe bournei木脂素合成途径关键酶基因Pinoresinol-lariciresinol reductase(PLR)特征及不同激素处理下的表达模式,探索闽楠PLR基因家族的生物学功能.[方法]利用生物信息学方法鉴定闽楠基因组中的PLR基因家族成员,分析基因结构、保守基序、染色体定位、系统进化、启动子顺式作用元件和激素响应.[结果]从闽楠全基因组内共鉴定出8个闽楠PLR(PbPLR)成员,不均匀地分布于第1、2、5和10号染色体.系统进化分析表明:PbPLR功能可能与底物立体选择性有关.启动子元件分析发现:PbPLRs启动子区域存在脱落酸、水杨酸和茉莉酸甲酯等激素响应元件;基因表达分析表明:PbPLRs基因的表达具有组织特异性和激素响应特征,其中PbPLRs基因在根中表达量最高,其次茎,叶中表达量较低;3种激素处理时,PbPLR2表达诱导最强.[结论]从闽楠基因组中鉴定出的8个PbPLRs基因,其基因特征和不同成员可能具有不同催化酶立体选择性,成员表达模式多样化,可能受多种激素诱导,具有组织特异性.
文献关键词:
闽楠;PLR基因家族;系统进化;激素处理;表达分析
作者姓名:
王倩清;张毓婷;张俊红;刘慧;童再康
作者机构:
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,浙江杭州311300
引用格式:
[1]王倩清;张毓婷;张俊红;刘慧;童再康-.闽楠PLR基因家族鉴定及响应激素的表达分析)[J].浙江农林大学学报,2022(06):1173-1182
A类:
lariciresinol,PbPLR,PbPLRs,PbPLR2
B类:
闽楠,基因家族鉴定,Phoebe,bournei,木脂素,合成途径,关键酶基因,Pinoresinol,reductase,激素处理,表达模式,生物学功能,利用生物,生物信息学方法,基因结构,保守基序,染色体定位,顺式作用元件,激素响应,全基因组,系统进化分析,底物,立体选择性,启动子区域,脱落酸,水杨酸和茉莉酸,茉莉酸甲酯,响应元,基因表达分析,有组织,组织特异性,响应特征,基因特征,催化酶,激素诱导
AB值:
0.281306
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