典型文献
基于单细胞转录组测序分析儿童腺样体免疫细胞异质性
文献摘要：
目的 通过单细胞测序技术绘制儿童腺样体组织单细胞转录组图谱,分析腺样体免疫细胞的异质性.方法 临床获取腺样体组织制成单细胞悬液,利用BD RhapsodyTM单细胞平台和Illumina二代测序技术获得单细胞全转录组数据,最后利用R和Python软件完成聚类分析、伪时间分析、功能分析、转录因子分析等工作.结果 共获得14618个高质量细胞,可聚类为8个主要细胞类型.作为主要的细胞类型T细胞和B细胞亚群经过非负矩阵分解后,分别聚类得到13和12个亚群,并分析其拟时序轨迹、转录因子调控网络和通路活性.结论 研究绘制了详细的腺样体单细胞转录组图谱,有利于深入了解儿童腺样体免疫细胞异质性.
文献关键词：
单细胞转录组测序;腺样体;异质性;免疫细胞
中图分类号：
作者姓名：
刘士玉;崔晶花;付彤彤;刘艳粉;袁静;杨瑞馥
作者机构：
军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,北京 100071;海军后勤部直属保障大队军需能源质量监督站,北京 100036;首都儿科研究所,北京 100020;河南省濮阳市中医医院,河南濮阳 457000
文献出处：
引用格式：
[1]刘士玉;崔晶花;付彤彤;刘艳粉;袁静;杨瑞馥-.基于单细胞转录组测序分析儿童腺样体免疫细胞异质性)[J].军事医学,2022(10):768-775
A类：
RhapsodyTM
B类：
单细胞转录组测序,转录组测序分析,儿童腺样体,免疫细胞,细胞异质性,单细胞测序技术,织制,成单,单细胞悬液,BD,Illumina,二代测序技术,技术获得,转录组数据,Python,时间分析,功能分析,共获,细胞类型,细胞亚群,群经,非负矩阵分解,调控网络
AB值：
0.253285
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