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油棕甾醇合成关键酶基因DWF5的克隆及表达分析
文献摘要:
DWARF5(DWF5)基因,编码7-脱氢胆固醇还原酶(7-dehydrocholesterol reductase),是甾醇合成的关键酶,通过调控甾醇的合成参与植物油体(oil bodies,OBS)的形成.为了探究DWF5基因对油棕果肉中油体发育的影响,以'热油4号'为材料,提取油棕果肉的RNA,以反转录的cDNA为模板进行基因的全长克隆,获得2个EgDWF5基因并分别命名为EgDWF5-1和EgDWF5-2.运用生物信息学的方法对其理化性质、结构特点和亲缘关系等进行分析预测,利用实时荧光定量PCR对其在油棕的根、茎、叶、花及花后不同时期的果实进行表达水平分析.结果表明:EgDWF5-1和EgDWF5-2基因编码的氨基酸数量分别为434个和374个,相对分子质量为49.71 kDa和42.68 kDa,等电点为8.61和8.69,其蛋白不稳定指数为38.60和38.13,脂肪族指数为98.80和96.68,总平均亲水性为0.347和0.313,均具有疏水性.EgDWF5与水稻和玉米亲缘关系最近,与其他物种关系较远.qRT-PCR分析表明,EgDWF5基因在油棕的各个器官均有表达,其中EgDWF5-1基因在果肉中高表达,显著高于根、叶、花等部位,其表达趋势为花后12~18周升高,至20周时达到最高后表达量逐渐降低,这与油棕果肉中油体的发育趋势基本一致.EgDWF5-2基因在根和茎中高表达而在果肉中表达量低,其果肉中表达趋势为花后12~18周逐渐降低.因此,推测EgDWF5-1参与调控油棕的油体发育,EgDWF5-2未参与该调控而可能在油棕的生长发育中发挥功能.本研究为进一步探索EgDWF5基因调控油棕中油体的形成机制奠定基础.
文献关键词:
油体;DWF5;生物信息学;基因表达
中图分类号:
作者姓名:
张为圣;刘智超;曹红星;颜彦;陈萍;李睿
作者机构:
海南大学园艺学院/海南省热带园艺作物品质调控重点实验室,海南海口 570228;中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室,海南文昌 571339;中国热带农业科学院生物技术研究所,海南海口 571101;海南大学三亚南繁研究院,海南三亚 572025
文献出处:
引用格式:
[1]张为圣;刘智超;曹红星;颜彦;陈萍;李睿-.油棕甾醇合成关键酶基因DWF5的克隆及表达分析)[J].热带作物学报,2022(06):1095-1101
A类:
DWF5,DWARF5,dehydrocholesterol,EgDWF5
B类:
油棕,甾醇,合成关键酶,关键酶基因,表达分析,还原酶,reductase,植物油,油体,oil,bodies,OBS,果肉,中油,热油,cDNA,全长,和亲,亲缘关系,分析预测,表达水平分析,基因编码,相对分子质量,kDa,等电点,脂肪族,亲水性,疏水性,水稻,较远,qRT,控油,基因调控
AB值:
0.218102
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