典型文献
山羊捻转血矛线虫ITS基因序列分析
文献摘要:
为了解不同年份山羊源捻转血矛线虫内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)基因的遗传变异情况,提取2015年-2020年间陕西省咸阳地区44株山羊源捻转血矛线虫的核糖体DNA(rDNA),对其ITS基因进行扩增、测序与分析.结果显示,44株捻转血矛线虫的ITS-1序列长度为400 bp~404 bp,种内变异率为0~4.1%,与GenBank中英国捻转血矛线虫ITS-1参考序列LS997563的相似性为97.01%~99.75%;ITS-2序列长度为231 bp,种内变异率为0~6.3%,与GenBank中尼日利亚捻转血矛线虫ITS-2参考序列LC368048的相似性为96.97%~100%.结果表明,2015年-2020年间咸阳地区山羊源捻转血矛线虫ITS-1、ITS-2基因均有不同程度的遗传变异,但未出现新的种群分化.此外,基于虫体代表性样本ITS-1、ITS-2序列构建的遗传进化树结果显示,不同国家和地区的分离株进化关系均较为接近,在ITS-1进化树中,只有捻转血矛线虫样本SX17-3与GenBank中陕西ITS-1序列(KX534100)汇于同一支上,在ITS-2进化树中,也只有SX15-8、SX17-9、SX17-113株捻转血矛线虫样本分离株与陕西ITS-1序列(KX534100)距离最近,表明捻转血矛线虫ITS基因序列的变异情况与地理条件之间无明显相关性.
文献关键词:
山羊;捻转血矛线虫;内转录间隔区;序列分析
中图分类号:
作者姓名:
要慧中;邹敏;杨冰可;周璐露;全钺涵;余传奇;林青
作者机构:
西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌 712100;商南县畜牧兽医中心,陕西商南 726300;家畜疫病病原生物学国家重点实验室(中国农业科学院兰州兽医研究所),甘肃兰州 730046
文献出处:
引用格式:
[1]要慧中;邹敏;杨冰可;周璐露;全钺涵;余传奇;林青-.山羊捻转血矛线虫ITS基因序列分析)[J].动物医学进展,2022(05):42-47
A类:
LS997563,LC368048,SX17,KX534100,SX15
B类:
山羊,捻转血矛线虫,ITS,基因序列分析,不同年份,内转录间隔区,internal,transcribed,spacer,遗传变异,变异情况,咸阳地区,核糖体,rDNA,bp,种内变异,GenBank,参考序列,尼日利亚,种群分化,虫体,代表性样本,遗传进化树,同国,分离株,进化关系,地理条件
AB值:
0.198574
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