典型文献
杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析
文献摘要：
BES1/BZR1是植物中特有的一类转录因子且是油菜素内酯(BR)信号转导途径的唯一转录因子,为探讨其在植物抗病抗逆反应中的作用,本研究通过运用生物信息学研究方法分析了杧果BES1s家族成员的理化性质、结构域、蛋白质结构和在不同胁迫条件下的基因表达.研究表明,杧果BES1s家族理化性质预测结果显示,成员外显子个数相差较大;结构域预测结果显示,杧果BES1s成员均具有BES1_N结构域;系统进化分析和二级结构表明,成员可分成3组,不同组之间成员存在较大差异、蛋白质三级结构预测结果显示,存在3种结构.在qRT-PCR法测定基因表达量中发现,在胶孢炭疽菌(Cg)侵染过程中MiBES1.1和MiBES1.5持续上调表达;MiBES1.12和MiBES1.13持续下调表达.在细菌性黑斑病菌(Xcm)侵染过程中,在12 h时除MiBES1.7和MiBES1.9,其他成员上调表达;在3 h时MiBES1.1～MiBES1.5和MiBES1.11下调表达.在茉莉酸甲酯(MeJA)处理过程中,MiBES1.7、MiBES1.9和MiBES1.2持续下调表达;在48 h时,除MiBES1.5和MiBES1.11～MiBES1.13其他成员下调表达.本研究结果可为杧果BES1s家族成员基因的功能研究提供依据.
文献关键词：
转录因子;杧果;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
夏煜琪;孙宇;刘志鑫;孙瑞青;杨楠;蒲金基;张贺
作者机构：
海南大学植物保护学院热带作物学院,海南海口570228;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室,海南 海口571101;中国热带农业科学院 热带生物技术研究所,海南 海口571101
文献出处：
引用格式：
[1]夏煜琪;孙宇;刘志鑫;孙瑞青;杨楠;蒲金基;张贺-.杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析)[J].浙江农业学报,2022(05):984-994
A类：
BES1s,MiBES1,Xcm
B类：
杧果,全基因组鉴定,生物信息学分析,BZR1,油菜素内酯,BR,信号转导途径,植物抗病,抗病抗逆,逆反应,生物信息学研究,结构域,蛋白质结构,胁迫条件,员外,外显子,域预测,系统进化分析,二级结构,三级结构,结构预测,qRT,基因表达量,胶孢炭疽菌,Cg,侵染过程,细菌性黑斑病,茉莉酸甲酯,MeJA,功能研究
AB值：
0.233846
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