典型文献
枳GRAS基因家族鉴定及其对低温胁迫的响应
文献摘要：
本研究基于枳(Poncirus trifoliata)基因组数据,利用生物信息学方法鉴定了枳GRS基因家族成员,分析了其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系和顺式作用元件,并通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)方法检测了PtrGRAS家族成员在低温胁迫下的相对表达量.结果 表明:在枳基因组中共鉴定出30个GRAS基因,分布在8条染色体上,氨基酸长度范围为441～833 aa,外显子数为1或2,其蛋白序列都具有保守的GRAS结构域;除PtrGRAS3、PtrG RAS11和PtrGRAS30外,其余PtrGRAS基因均分布于细胞核;系统进化分析将30个PtrGRAS基因分成10个亚族;顺式作用元件预测分析得到12个含有低温响应元件的PtrGRAS基因.qRT-PCR数据表明,12个PtrGRAS基因在低温胁迫下的相对表达量与对照相比存在显著差异,其中,PtrGRAS11、PtrGRAS26和PtrGRAS30受到低温胁迫的强烈诱导,这3个基因的表达量在处理各时期均显著上调.推测PtrGRAS家族成员在抵抗低温胁迫中发挥重要作用.
文献关键词：
枳;GRAS;基因家族;进化分析;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
杨杰;陈蓉;胡文娟;吴巧玲;佟晓楠;李兴涛
作者机构：
赣南师范大学生命科学学院/国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州341000
文献出处：
引用格式：
[1]杨杰;陈蓉;胡文娟;吴巧玲;佟晓楠;李兴涛-.枳GRAS基因家族鉴定及其对低温胁迫的响应)[J].植物生理学报,2022(01):130-140
A类：
PtrGRAS,PtrGRAS3,PtrG,RAS11,PtrGRAS30,PtrGRAS11,PtrGRAS26
B类：
基因家族鉴定,低温胁迫,Poncirus,trifoliata,基因组数据,利用生物,生物信息学方法,GRS,染色体定位,基因结构,保守基序,进化关系,和顺,顺式作用元件,qRT,相对表达量,aa,外显子,结构域,细胞核,系统进化分析,预测分析,低温响应,响应元,抗低温,表达模式
AB值：
0.234973
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