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三角褐指藻岩藻黄素合成相关的ZEP家族基因的生物信息学、亚细胞定位及表达分析
文献摘要：
目的 克隆三角褐指藻(Phaeodoctylum tricornutum)玉米黄质环氧化酶ZEP家族基因,为深入研究其在岩藻黄素合成途径中的功能奠定基础.方法 通过转录组测序获得了 3条三角褐指藻ZEP家族基因(ZEP1、ZEP2和ZEP3)的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析.构建瞬时表达载体,经农杆菌介导转染烟草,在共聚焦显微镜下观察其亚细胞定位.用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测ZEP家族基因的表达.结果 三角褐指藻ZEP1、ZEP2和ZEP3蛋白均属于FAD/NAD(P)-binding domain同源超家族,为亲水酸性蛋白,存在信号肽,其中ZEP1和ZEP3属于跨膜蛋白,ZEP2不属于跨膜蛋白.系统进化树分析结果表明,三角褐指藻与圆柱拟脆杆藻(Fragilariopsis cylindrus)和假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)等硅藻的ZEP蛋白亲缘关系最近.亚细胞定位结果表明,三角褐指藻ZEP1和ZEP2蛋白定位于叶绿体上,而ZEP3蛋白定位于细胞质上.qRT-PCR结果表明,随着光合诱导素(photosynthetic induction factor,PIF)浓度的增加,3个基因的表达整体呈上升趋势,岩藻黄素的含量逐渐升高.结论 ZEP家族基因表达与岩藻黄素含量变化趋势均一致,说明该家族基因的表达可能与岩藻黄素的生物合成存在一定的关系.
文献关键词：
三角褐指藻;玉米黄质环氧化酶;岩藻黄素;生物信息学分析;亚细胞定位
中图分类号：
作者姓名：
贾泽茗;龚一富;章丽;舒明雨;王博;聂志伟;黎治富;王何瑜
作者机构：
宁波大学海洋学院,浙江省海洋生物工程重点实验室,浙江宁波315832;宁波大学食品与药学学院,浙江宁波315832
文献出处：
引用格式：
[1]贾泽茗;龚一富;章丽;舒明雨;王博;聂志伟;黎治富;王何瑜-.三角褐指藻岩藻黄素合成相关的ZEP家族基因的生物信息学、亚细胞定位及表达分析)[J].中国药学杂志,2022(24):2067-2076
A类：
Phaeodoctylum,玉米黄质环氧化酶,ZEP1,ZEP2,ZEP3,Fragilariopsis,cylindrus,pseudonana
B类：
三角褐指藻,岩藻黄素,家族基因,亚细胞定位,表达分析,tricornutum,合成途径,转录组测序,cDNA,全长,生物信息学分析,瞬时表达,表达载体,农杆菌介导,转染,烟草,共聚焦显微镜,显微镜下,实时荧光定量聚合酶链式反应,qRT,FAD,NAD,binding,domain,超家族,亲水,信号肽,跨膜蛋白,系统进化树分析,圆柱,Thalassiosira,硅藻,亲缘关系,定位结果,蛋白定位,叶绿体,细胞质,光合,photosynthetic,induction,PIF,含量变化,均一,生物合成
AB值：
0.227336
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