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tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制
文献摘要:
随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定.tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和 tRNA 应激诱导 RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA),其中tRF是一类具有调节功能的非编码RNA.为了加深对tRF的研究,近年来一些基于测序数据的tRF鉴定方法和相关数据库不断涌现,前者主要包括Telonis等人的算法和tDRmapper方法,后者主要有tRFdb、tRF2Cancer和MINTbase等.同时这两者为tRF的深入研究提供了更有效的工具.大量的研究表明,tRF主要以类似miRNA的方式对RNA、DNA及蛋白质进行调节,但也存在特异的作用方式.随着对这三者的深入研究,研究人员发现tRF在人类疾病的各种生物过程中也扮演着重要的角色,例如可以作为生物标志物.因此本文主要对tRF的鉴定方法、数据库、对靶分子的调节机制及其与人类疾病的关系作一综述.
文献关键词:
tRNA衍生小分子;tRNA衍生片段;数据库;生物信息学鉴定
作者姓名:
黄炯杰;陈乐意;廖奇
作者机构:
宁波大学医学院预防医学系,浙江省病理生理重点实验室,浙江,宁波315211
引用格式:
[1]黄炯杰;陈乐意;廖奇-.tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制)[J].中国生物化学与分子生物学报,2022(04):438-451
A类:
tiRNA,Telonis,tDRmapper,tRFdb,tRF2Cancer,MINTbase
B类:
tRNA,对靶,调节机制,小分子,derived,small,tsRNAs,切割位点,fragment,stress,induced,调节功能,非编码,序数,鉴定方法,miRNA,作用方式,人类疾病,生物过程,生物标志物,生物信息学鉴定
AB值:
0.21108
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