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斑地锦RT-qPCR内参基因的筛选
文献摘要：
实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的前提条件之一是具有合适的内参基因.为筛选斑地锦(Euphorbia maculata)合适的RT-qPCR内参基因,该文利用同源克隆法克隆斑地锦GAPDH、EF-1α、act、UBQ、TUB-α、eIF-4A、CYP等基因片段,RT-qPCR检测7个候选内参基因在斑地锦不同生长期根、茎、叶和果实中的表达情况,并用geNorm、NormFinder和BestKeeper等生物学软件对各候选基因表达稳定性进行评价.结果表明:(1)克隆的GAPDH、EF-1α、act、UBQ、TUB-α、eIF-4A、CYP基因片段为729、808、753、422、233、656、313 bp,分别编码242、269、250、140、77、218、103个氨基酸,与其他植物相应氨基酸序列的最高同源性均在85％以上.(2)综合3个分析软件分析内参基因表达稳定性得出,表达稳定性排名为UBQ>EF-1α>TUB-α>eIF-4A>GAPDH>CYP>act.因此,可以选取UBQ作为斑地锦RT-qPCR分析的内参基因,用于不同生长期基因组织特异性表达研究.
文献关键词：
斑地锦;基因克隆;内参基因;RT-qPCR
中图分类号：
作者姓名：
宋美玲;黄胜和;陈祖杰;邹嘉轩;刘欢胜;全文军
作者机构：
江西中医药高等专科学校 医学基础部,江西 抚州 344000;南昌大学 江西医学院,南昌 330031;南昌大学 抚州医学院,江西 抚州 344000
文献出处：
引用格式：
[1]宋美玲;黄胜和;陈祖杰;邹嘉轩;刘欢胜;全文军-.斑地锦RT-qPCR内参基因的筛选)[J].广西植物,2022(02):340-348
A类：
斑地锦
B类：
qPCR,内参基因,前提条件,Euphorbia,maculata,同源克隆,GAPDH,EF,act,UBQ,TUB,eIF,4A,CYP,不同生长期,geNorm,NormFinder,BestKeeper,候选基因,基因表达稳定性,bp,分别编,氨基酸序列,同源性,组织特异性,特异性表达,表达研究,基因克隆
AB值：
0.257466
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