典型文献
山核桃实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选与验证
文献摘要:
[目的]筛选出山核桃中的最佳内参基因.[方法]以山核桃的根、茎、叶、柱头、果皮、胚、不同处理下的叶片及嫁接后的砧木和接穗为试验材料,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder4种软件对10个管家基因家族(ARF、ACT1、ACT7、MPS、UBC9、CYP、60SRP、EF-1α、GAPHD和HIS)中的19个候选内参基因表达的稳定性进行综合分析.[结果]通过比较不同组织内参基因表达的稳定性,排名前五的5个基因(ARF-1、60SRP、ACT7-1、ACT1-1和UBC9-5)被选出且ARF-1和60SRP的表达最稳定.geNorm分析显示:在盐、干旱及嫁接处理后,60SRP的表达最稳定;外源喷施不同激素到山核桃叶面后,UBC9-5的表达最为稳定;综合所有组织和处理发现UBC9-5为最稳定表达的基因.NormFinder和RefFinder综合分析的结果与geNorm分析结果基本一致,而与BestKeeper分析相差较大.[结论]在山核桃的不同组织及不同试验处理中,最适的内参基因有所不同,其也受分析方法的影响.
文献关键词:
山核桃;组织;内参基因;实时荧光定量PCR
中图分类号:
作者姓名:
赵艺蕊;黄春颖;王克涛;徐一帆;王建华;邢语琳;陶瞫宸;黄坚钦;李岩
作者机构:
浙江农林大学,浙江临安311300
文献出处:
引用格式:
[1]赵艺蕊;黄春颖;王克涛;徐一帆;王建华;邢语琳;陶瞫宸;黄坚钦;李岩-.山核桃实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选与验证)[J].果树学报,2022(01):10-21
A类:
RefFinder4,ACT1,ACT7,60SRP
B类:
山核桃,内参基因,出山,柱头,果皮,不同处理,嫁接,砧木,接穗,geNorm,NormFinder,BestKeeper,管家基因,基因家族,ARF,MPS,UBC9,CYP,EF,GAPHD,HIS,不同组织,外源喷施,核桃叶,叶面,有组织,稳定表达
AB值:
0.28337
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