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典型文献
贵州普安四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性分析
文献摘要:
[目的]从分子水平上分析普安四球茶的遗传多样性,为今后四球茶的保护、育种及利用研究奠定基础.[方法]利用22对EST-SSR引物分析贵州普安的4个不同居群的141份四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性和居群结构.[结果]22对EST-SSR引物共扩增出72条多态性谱带,物种水平上,观测等位基因(Na)的数值最小为3.0000,分别是CsEMS147、CsEMS148、CsEMS152和CsEMS194,最大为6.0000,是CsEMS27和CsEMS117,平均为4.2273;有效等位基因数(Ne)最小值为1.6473,是CsEMS152,最大值为3.7981,是CsEMS117,平均2.7874;Shannon信息多样性指数(I)在0.6846(CsEMS152)~1.5059(CsEMS117),变幅0.8213,变化范围较大,平均Shannon指数为1.1454,Nei基因多样性指数(H)平均值是0.6227,范围在0.3929(CsEMS152)~0.7367(CsEMS117);引物的多态信息含量(PIC)在13.3%~78.69%,平均为64.38%,说明普安四球茶树居群遗传多样性高.通过POPGENE分析得到居群内近交系数Fis为0.1293,居群分化系数Fst仅为0.046,基因流Nm为5.0853,说明普安四球茶树遗传变异主要分布于其居群内部,基因交流丰富.分子差异分析表明,四球茶树居群的遗传变异7%发生在居群间,93%发生在居群内.遗传相似系数为0.8380~0.9438,平均值为0.898,遗传距离在0.0578~0.1767,平均值为0.1084.以遗传相似度为阈值,对普安四球茶不同居群进行UPGMA聚类分析得到野生型古茶树和栽培型古茶树遗传相似度最高,栽培型茶树和千年野生型古茶树遗传相似度最低,与POPGENE分析得到的不同居群遗传相似性和遗传距离结果一致.STRUCTURE和PCA分析,得到四球茶居群间遗传距离较近,遗传分化明显.[结论]普安四球茶树居群具有丰富的遗传多样性,4个居群间遗传分化明显,亲缘关系较近.
文献关键词:
四球茶;遗传多样性;居群结构
作者姓名:
罗雯;陈艳艳;尹世华;王莉飞;黄晓霞;耿芳;程小毛
作者机构:
西南林业大学 园林园艺学院/云南省古茶树资源保护与利用研究中心,云南 昆明 650224
引用格式:
[1]罗雯;陈艳艳;尹世华;王莉飞;黄晓霞;耿芳;程小毛-.贵州普安四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性分析)[J].江西农业大学学报,2022(01):74-85
A类:
四球茶,tetracocca,CsEMS147,CsEMS148,CsEMS152,CsEMS194,CsEMS27,CsEMS117,POPGENE
B类:
普安,Camellia,Zhang,种质资源,遗传多样性分析,分子水平,育种,利用研究,EST,SSR,引物,不同居群,居群结构,多态性,等位基因,Na,最小值,Shannon,信息多样性,多样性指数,变幅,变化范围,Nei,多态信息含量,PIC,近交系数,Fis,Fst,基因流,Nm,遗传变异,基因交流,分子差异,遗传相似系数,遗传距离,UPGMA,野生型,古茶树,栽培型,遗传相似性,STRUCTURE,遗传分化,亲缘关系
AB值:
0.211105
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