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典型文献
胃癌中FKBP5的表达及其与免疫浸润和预后相关性研究
文献摘要:
目的 探究FKBP5在为胃癌中的表达、预后意义及其与免疫浸润的关系.方法 利用TIMER数据库分析FKBP5在多种肿瘤中的表达;在癌症基因组图谱(TCGA)胃癌数据集中比较FKBP5在胃癌与癌旁正常组织及不同病理亚组中的表达差异;TCGA和KMplotter数据库分析FKBP5与患者预后的关系;基因富集分析(GSEA)分析FKBP5高表达组富集信号通路;应用TIMER数据库分析FKBP5与免疫浸润水平的关系,并分析不同免疫细胞浸润对胃癌患者预后的影响;Pearson相关分析FKBP5与经典免疫相关基因的表达相关性.结果 FKBP5在多种肿瘤组织中表达失调,在胃癌组织较癌旁正常组织表达下调;FKBP5表达水平随着T分期和病理分级的增高而升高;生存分析显示FKBP5 mRNA高表达的胃癌患者总生存率低于FKBP5低表达的胃癌患者(HR>1.50,P<0.05).GSEA分析显示,FKBP5 mRNA高表达组胃癌样本在同种异体排斥、上皮间质转化、HEDGEHO信号、炎症反应、肌生成等信号通路富集(ES>1.50,P<0.05).在胃癌组织中,FKBP5表达与CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的浸润呈正相关(cor>0.35,P<0.05);巨噬细胞浸润水平较高的样本,患者的预后更差.FKBP5表达水平与大部分免疫相关基因明显正相关(cor>0.45,P<0.05).结论 在胃癌中,FKBP5基因高表达与肿瘤T分期、组织学分级、不良预后及CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的浸润水平显著相关,可以作为预测胃癌患者预后的生物标志物和治疗靶点.
文献关键词:
胃癌;生物信息学;FKBP5基因;预后;免疫浸润
作者姓名:
刘伟强;符洋
作者机构:
郑州大学第一附属医院胃肠外科,河南郑州450052
文献出处:
引用格式:
[1]刘伟强;符洋-.胃癌中FKBP5的表达及其与免疫浸润和预后相关性研究)[J].肿瘤基础与临床,2022(02):106-112
A类:
KMplotter,HEDGEHO
B类:
FKBP5,预后相关性,预后意义,TIMER,数据库分析,癌症基因组图谱,TCGA,中比,癌旁,正常组织,表达差异,基因富集分析,GSEA,免疫浸润水平,免疫细胞浸润,胃癌患者,免疫相关基因,肿瘤组织,组织中表达,胃癌组织,组织表达,病理分级,生存分析,总生存率,低表达,同种异体,上皮间质转化,信号通路富集,ES,CD4+T,CD8+T,树突状细胞,cor,巨噬细胞浸润,因明,组织学分级,不良预后,生物标志物,治疗靶点
AB值:
0.227044
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