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一株MLB1型星状病毒全基因组序列分析
文献摘要：
了解我国MLB1型星状病毒基因组特征,为星状病毒腹泻的防控提供基础数据.使用星状病毒通用引物筛查北京市丰台区2017年72份儿童腹泻监测病例标本;扩增MLB星状病毒全基因组序列,采用在线比对、进化、重组等生物学信息学方法分析MLB1的全基因组序列.从72份标本中检出2份1型星状病毒(2.78％)和1份MLB1型星状病毒(MLB1-FT)(1.39％).MLB1-FT与GenBank已报道的MLB1型星状病毒全基因组相似性为92.51％～98.28％;MLB1-FT的三个ORF区,仅5个位点氨基酸与其他株均不相同.依据其ORF2部分序列的进化分析,MLB1可分为A和B两个组,其中A组可分为a和b亚组,MLB1-FT为A组中的b亚组.未发现MLB1-FT具有重组现象.MLB1-FT具有星状病毒特征性的保守基序,部分保守基序与其他型别星状病毒不一样,为MLB1星状病毒特有.MLB1-FT具备新型星状病毒MLB的典型特征.我国新型星状病毒监测力度较弱,应加强监测.
文献关键词：
新型星状病毒;MLB1;腹泻病毒
中图分类号：
作者姓名：
王雅璐;秦萌;高升辉;李静欣;毛彤瑶;李丹地;李利利;赵璐;李金松;吴建军;段招军
作者机构：
甘肃中医药大学公共卫生学院,兰州730000;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206;北京市丰台区疾病预防控制中心,北京100070
文献出处：
引用格式：
[1]王雅璐;秦萌;高升辉;李静欣;毛彤瑶;李丹地;李利利;赵璐;李金松;吴建军;段招军-.一株MLB1型星状病毒全基因组序列分析)[J].病毒学报,2022(06):1315-1321
A类：
MLB1,新型星状病毒
B类：
一株,全基因组序列分析,病毒基因组,基因组特征,通用引物,北京市丰台区,份儿,儿童腹泻,监测病例,FT,GenBank,个位,ORF2,进化分析,病毒特征,特征性,保守基序,分保,型别,典型特征,测力,腹泻病毒
AB值：
0.160074
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