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枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的生物信息学分析
文献摘要：
该研究应用生物信息学方法对枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA进行分析,旨在为LipA的后续研究奠定一定的理论基础.采用一系列在线网站或软件对LipA的一级结构、亲疏水性、基本特性、二级结构、特殊卷曲螺旋、模体以及富含脯氨酸(P)、谷氨酸(E)、丝氨酸(S)和苏氨酸(T)的PEST序列等进行预测和分析,并对三级结构进行同源建模,对其表面电位、可及性分布以及Ramachandran图等进行分析.枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA是一种由212个氨基酸组成的稳定的脂溶性蛋白质,其亲、疏水性最强的区域分别为Lys75～Asn81和Val9～Leu17;不存在稳定的二聚体、三聚体卷曲螺旋和非PEST序列;有3种可能参与不同的生化反应的模体;有5段α-螺旋、6段β-折叠的α/β 类蛋白;整体呈弱正电势;LipA的可及性和Ramachandran图表明建模得到的三维结构是合理、可靠的.该研究为后续对枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的分子设计和改造提供了 一定的理论基础.
文献关键词：
枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA;生物信息学;同源建模
中图分类号：
作者姓名：
黎菁菁;赖昕珏;李鑫尧;马俊炜;余铭怡;罗佳伟;陈胤熹;余洁婷;郑少鹏;郑敦锦;曹诗林;陈宛涓
作者机构：
佛山科学技术学院广东省食品智能制造重点实验室,广东佛山528000;佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东佛山528000;佛山科学技术学院材料科学与氢能学院,广东佛山528000
文献出处：
引用格式：
[1]黎菁菁;赖昕珏;李鑫尧;马俊炜;余铭怡;罗佳伟;陈胤熹;余洁婷;郑少鹏;郑敦锦;曹诗林;陈宛涓-.枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的生物信息学分析)[J].现代食品科技,2022(07):113-119,10
A类：
LipA,Ramachandran,Lys75,Asn81,Val9,Leu17
B类：
枯草芽孢杆菌,脂肪酶,生物信息学分析,研究应用,生物信息学方法,线网,亲疏水性,基本特性,二级结构,卷曲螺旋,模体,脯氨酸,谷氨酸,丝氨酸,苏氨酸,PEST,三级结构,行同,同源建模,表面电位,可及性,氨基酸组成,脂溶性,二聚体,三聚体,生化反应,折叠,正电,电势,图表,三维结构,分子设计
AB值：
0.234819
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