典型文献
新冠病毒相关蛋白TMPRSS2结构与功能的生信分析及表达载体构建
文献摘要：
目的 人源TMPRSS2是一种跨膜丝氨酸蛋白酶,本文对该蛋白结构与功能进行系统生物信息学分析,优化密码子并构建原核表达载体,以探究其参与SARS-CoV-2侵染宿主细胞的分子机制.方法 利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-TMPRSS2;采用Protparam、NetPhos3.1、Blast、Clustal X2和MEGA7.0等分析工具对TMPRSS2蛋白的同源性、功能位点、亚细胞定位、三维结构和进化特点等进行生信分析.结果 原核表达质粒构建正确;TMPRSS2蛋白属于中等分子量蛋白,由492个氨基酸残基构成,理论等电点为8.12,分子消光系数为118145 L·mol-1·cm-1,半衰期30 h;TMPRSS2有15个潜在的糖基化位点,49个可能的磷酸化位点,无信号序列,是一种跨膜的亲水性蛋白.此外,该蛋白有13个潜在的B细胞表位及7个T细胞表位.二级结构分析显示,Random coil在TMPRSS2蛋白中占比最高(0.4533),其次是Extended strand(0.2520).序列对比和进化分析显示,与人源TMPRSS2序列一致性最高且亲缘关系最近的是Pan troglodytes,其次是Gorilla.结论 人源TMPRSS2蛋白在进化上保守,功能重要.本研究结果有助于揭示TM-PRSS2蛋白的结构和作用机理,为新冠肺炎的诊疗提供思路,加速了靶向TMPRSS2蛋白的新型药物研发进程.
文献关键词：
新冠病毒;TMPRSS2;生信分析;载体构建;结构与功能;进化分析
中图分类号：
作者姓名：
徐本锦;李卓禧;范蕾;李璟;严荣荣;杜淼;宣焱;门杰;陈晓聪;汤文婷;侯艳香;宋彬妤;杨娅男;刘晓梁;余骏骁;刘玲
作者机构：
山西医科大学汾阳学院 医学检验系,山西 汾阳 032200;山西医科大学汾阳学院 基础医学部,山西 汾阳 032200;山西医科大学汾阳学院 山西省汾阳医院检验科,山西 汾阳 032200;山西医科大学汾阳学院 科技中心,山西 汾阳 032200
文献出处：
引用格式：
[1]徐本锦;李卓禧;范蕾;李璟;严荣荣;杜淼;宣焱;门杰;陈晓聪;汤文婷;侯艳香;宋彬妤;杨娅男;刘晓梁;余骏骁;刘玲-.新冠病毒相关蛋白TMPRSS2结构与功能的生信分析及表达载体构建)[J].中国药理学通报,2022(08):1218-1226
A类：
troglodytes,Gorilla
B类：
新冠病毒,TMPRSS2,结构与功能,生信分析,表达载体构建,丝氨酸蛋白酶,蛋白结构,生物信息学分析,密码子,原核表达载体,SARS,CoV,侵染,宿主,主细胞,分子克隆,克隆技术,技术构建,重组表达,pET,22b,Protparam,NetPhos3,Blast,Clustal,X2,MEGA7,同源性,亚细胞定位,三维结构,质粒构建,中等分子量,氨基酸残基,基构,等电点,消光系数,半衰期,糖基化位点,磷酸化,亲水性,细胞表位,二级结构,Random,coil,Extended,strand,进化分析,序列一致性,亲缘关系,Pan,新型药物,药物研发
AB值：
0.408104
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