典型文献
豹皮樟纤维素合酶基因家族的鉴定与表达分析
文献摘要:
纤维素合酶基因在初生细胞壁和次生细胞壁的合成中发挥着不同的作用,影响着豹皮樟纤维素含量以及老鹰茶的品质.本试验应用生物信息学方法,从豹皮樟中鉴定出17个纤维素合酶(CesA)基因,根据系统进化关系将这些基因分为7个亚组,进行了基因结构、染色体定位和不同部位基因表达分析.结果表明,所有基因均具有纤维素结构域,且不均等地分布在染色体上;RNA-seq数据分析表明,LcoCesA1_1/3_2/3_5/3_1/3_3/2_2在各个组织中表达较为显著,在根、茎以及其他部位中相对表达量普遍最高的是LcoCesA3_1,推测其在纤维素合成中发挥着重要作用.研究表明,该家族蛋白相对分子量为18834.17~128366 kD之间;理论等电点(pI)介于5.07~8.74之间,一半以上的LcoCesA蛋白富含酸性氨基酸.
文献关键词:
纤维素;纤维素合酶;豹皮樟;表达分析;基因结构
中图分类号:
作者姓名:
姚新转;李倩倩;张宝会;吕立堂
作者机构:
贵州大学茶学院,贵阳 550025;贵州大学农业生物工程研究院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室/山地生态与农业生物工程协同创新中心,贵阳 550025
文献出处:
引用格式:
[1]姚新转;李倩倩;张宝会;吕立堂-.豹皮樟纤维素合酶基因家族的鉴定与表达分析)[J].种子,2022(12):41-47
A类:
LcoCesA1,LcoCesA3,LcoCesA
B类:
豹皮樟,纤维素合酶基因,基因家族,初生,次生细胞壁,纤维素含量,老鹰茶,生物信息学方法,系统进化,进化关系,基因结构,染色体定位,不同部位,基因表达分析,纤维素结构,结构域,seq,组织中表达,相对表达量,白相,相对分子量,kD,等电点,pI,含酸,酸性氨基酸
AB值:
0.310372
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