典型文献
17种绵蟹线粒体COI基因比较及系统进化分析
文献摘要:
线粒体COI基因在物种鉴定及系统进化研究中有着广泛的应用.本研究测定了德汉劳绵蟹和阿特拉斯平壳蟹的线粒体COI序列,并从GenBank数据库中下载了15种绵蟹科种类的COI基因序列.对这17种绵蟹种类的COI序列进行比较分析发现遗传密码具有简并性.遗传距离及序列相似性分析显示4个德汉劳绵蟹个体中的德汉劳绵蟹2和3鉴定有误;本研究中所有物种都能被区分开,表明COI基因可以作为绵蟹科物种鉴定的分子标记.基于COI序列构建的最大似然树、贝叶斯树和最大简约树在属间水平差异较大,且支持率均较低,暗示COI片段有限的信息位点不适用于绵蟹科的系统发育分析;但是3种方法构建的系统树均表明绵蟹科未定种1和6以及德汉劳绵蟹1和4分别为同一物种,与遗传距离及序列相似性结果吻合.本研究在识别隐种及发现新种方面具有十分重要的潜在价值,同时也为生物多样性保护管理提供决策参考.
文献关键词:
绵蟹;DNA条形码;物种鉴定;同义密码子;遗传距离;系统发育
中图分类号:
作者姓名:
韦丽明;张莹;吕振明;龚理;苗增良
作者机构:
浙江海洋大学海洋科学与技术学院,海洋生物种质发掘与利用国家地方联合工程实验室,浙江舟山 316022
文献出处:
引用格式:
[1]韦丽明;张莹;吕振明;龚理;苗增良-.17种绵蟹线粒体COI基因比较及系统进化分析)[J].浙江海洋大学学报(自然科学版),2022(03):202-210,220
A类:
绵蟹
B类:
COI,系统进化分析,物种鉴定,阿特拉斯,GenBank,下载,基因序列,遗传密码,简并,遗传距离,相似性分析,有误,所有物,种都,分子标记,最大似然,简约,属间,支持率,暗示,系统发育分析,未定,一物,新种,潜在价值,生物多样性保护,保护管理,决策参考,条形码,同义密码子
AB值:
0.283591
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