典型文献
铁皮石斛RRT家族全基因组鉴定及表达分析
文献摘要：
多糖是药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale)的主要成分之一.鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶(rhamnogalacturon Ⅰ rhamnosyltransferase,RRT)在Ⅰ型鼠李半乳糖醛酸聚糖的合成中起重要作用.利用生物信息学在全基因组水平鉴定出4个铁皮石斛RRT家族基因(DoRRT1、DoRRT2、DoRRT3、
DoRRT4),通过逆转录定量PCR检测该基因家族在不同组织和胁迫下的表达情况.结果表明:在系统发育上DoRRT1、DoRRT3被聚为一组,DoRRT2、DoRRT4被聚为一组;DoRRT蛋白均为亲水蛋白质,可定位于高尔基体;DoRRT蛋白的α-螺旋和无规卷曲较多;4个DoRRT蛋白均有O-FucT保守结构域;组织表达显示DoRRT1、DoRRT2、DoRRT4在根、茎、叶中均有表达,且在地上部的转录水平较高;胁迫表达表明DoRRT2、DoRRT4在高温胁迫下表达显著下调,DoRRT2在PEG模拟干旱条件下表达显著下调,说明DoRRT2、DoRRT4参与非生物胁迫响应.以上结果为深入研究DoRRT的生物学功能提供数据支撑.
文献关键词：
铁皮石斛;鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶RRT;生物信息学分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
聂聪;龙小琴;何基泽;孙语钒;赵欣宇;王万军;朱乾坤
作者机构：
西南交通大学生命科学与工程学院,成都 610031
文献出处：
引用格式：
[1]聂聪;龙小琴;何基泽;孙语钒;赵欣宇;王万军;朱乾坤-.铁皮石斛RRT家族全基因组鉴定及表达分析)[J].西北农业学报,2022(12):1605-1614
A类：
rhamnogalacturon,rhamnosyltransferase,DoRRT1,DoRRT2,DoRRT3,
DoRRT4,DoRRT4,DoRRT,FucT
B类：
铁皮石斛,全基因组鉴定,表达分析,药用植物,Dendrobium,officinale,半乳糖醛酸,鼠李糖,转移酶,利用生物,家族基因,逆转录,基因家族,不同组织,系统发育,亲水蛋白质,高尔基体,无规,卷曲,保守结构域,组织表达,地上部,转录水平,高温胁迫,PEG,非生物胁迫,胁迫响应,生物学功能,生物信息学分析
AB值：
0.190914
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