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低温胁迫下红榄李(Lumnitzera littorea)DEAD-box RNA解旋酶基因的表达分析
文献摘要：
转录组分析发现DEAD-box RNA解旋酶家族参与红榄李(Lumnitzera littorea)对低温胁迫的响应.本文对4个低温显著差异表达基因LlDEAD12,LlDEAD32,LlDEAD43和LlDEAD65的生物信息学特性、组织特异性以及在不同温度处理下的红榄李幼苗中的差异表达进行研究.结果表明,L1DEAD12、L1DEAD32、L1DEAD43和L1DEAD65均属于疏水性蛋白,二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,具有多个糖基化位点和磷酸化位点,且不含有跨膜结构域和信号肽.亚细胞定位分析表明,L1DEAD12和L1DEAD32分别定位于细胞质和细胞核,而L1DEAD43和L1DEAD65则定位于线粒体上.通过蛋白质氨基酸序列的比对分析发现L1DEAD12、L1DEAD32和L1DEAD43分别与马尾松(Pinus massoniana)、巨桉(Eucalyptus grandis)和石榴(Punica granatum)的 DEAD-box RNA 解旋酶有较近的亲缘关系.荧光定量PCR技术分析发现,LlDEAD12和LlDEAD32在叶中高表达,LlDEAD43和LlDEAD65在茎和花中高表达,但这4个基因在根中都不表达,说明这4个基因对红榄李生长发育的调控主要集中在叶、茎和花等器官.低温胁迫对红榄李幼苗这4个基因的表达均有显著的抑制,说明它们参与了红榄李在低温环境下的分子响应,其中LlDEAD12和LlDEAD32可能参与了叶绿体的发育,LlDEAD43和LlDE4D65可能参与到了维持线粒体功能的稳定.以上结果可为红榄李抗冷性苗木的培育提供科学依据.
文献关键词：
红树林;红榄李;DEAD-box解旋酶;低温胁迫;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
郝露露;柯明思;朱奕秀;许燕敏;张颖;郑春芳
作者机构：
温州大学生命与环境科学学院,浙江温州325035;岭南师范学院生命科学与技术学院,广东湛江524048;海南省林业科学研究(海南省红树林研究院),海南海口 571129
文献出处：
引用格式：
[1]郝露露;柯明思;朱奕秀;许燕敏;张颖;郑春芳-.低温胁迫下红榄李(Lumnitzera littorea)DEAD-box RNA解旋酶基因的表达分析)[J].热带海洋学报,2022(06):44-55
A类：
红榄李,Lumnitzera,littorea,LlDEAD12,LlDEAD32,LlDEAD43,LlDEAD65,L1DEAD12,L1DEAD32,L1DEAD43,L1DEAD65,LlDE4D65
B类：
低温胁迫,box,解旋酶,酶基因,表达分析,转录组分析,家族参与,差异表达基因,组织特异性,温度处理,幼苗,疏水性,二级结构,无规则,卷曲,糖基化位点,磷酸化,跨膜结构域,信号肽,亚细胞定位,定位分析,细胞质,细胞核,氨基酸序列,比对分析,马尾松,Pinus,massoniana,巨桉,Eucalyptus,grandis,石榴,Punica,granatum,亲缘关系,低温环境,叶绿体,线粒体功能,抗冷性,苗木,红树林,生物信息学分析
AB值：
0.232786
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