典型文献
利用集群分离分析结合高密度芯片快速定位小麦成株期抗条锈病基因YrC271
文献摘要：
由国际玉米小麦改良中心(CIMMYT)培育的春小麦高代选系C271对小麦条锈病保持抗性近40年.为明确C271的抗条锈病遗传组分,利用感病品种晋麦79与C271杂交构建含有229个F2:3家系的遗传群体,并于2019年在陕西杨凌和四川江油进行成株期病害调查.运用集群分离分析(BSA)结合高密度660K芯片策略在3B染色体短臂上快速挖掘出大量的与抗病关联的SNP,利用等位基因特异的定量PCR标记(AQP)进行验证并作图,成功检测到一个效应值较大的QTL,可解释表型变异为22.7％～30.8％,暂命名为YrC271,位于标记AX-109001377和AX-111087256之间,约1.9 cM,对应的物理距离1.9 Mb.利用已公布的小麦基因组信息对该区间进行比较基因组分析,结果表明,与中国春基因组相比,不同材料间存在小片段的插入以及倒位现象,但总体共线性良好.同时利用1484份小麦660K分型数据对该区间进行单倍型分析,总体可分为5种区间单倍型,其中C271所在的单倍型组的抗性优于其他组.虽然C271不含有Yr30和Yr58连锁标记的阳性片段,但从相对遗传位置、条锈病抗性表现以及育种系谱看,YrC271与Yr30和Yr58都很类似,其关系需要进一步确认.对主效QTL定位来讲,芯片结合BSA策略可快速锁定目标QTL区域,再应用AQP技术既提高了作图效率,也降低了标记分析的成本,为高通量基因/QTL定位工作提供了借鉴.
文献关键词：
条锈病成株抗性;YrC271;SNP标记;比较基因组分析;单倍型分析
中图分类号：
作者姓名：
刘丹;周彩娥;王晓婷;吴启蒙;张旭;王琪琳;曾庆东;康振生;韩德俊;吴建辉
作者机构：
西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌 712100;西北农林科技大学植物保护学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌 712100
文献出处：
引用格式：
[1]刘丹;周彩娥;王晓婷;吴启蒙;张旭;王琪琳;曾庆东;康振生;韩德俊;吴建辉-.利用集群分离分析结合高密度芯片快速定位小麦成株期抗条锈病基因YrC271)[J].作物学报,2022(03):553-564
A类：
YrC271,C271,Yr30,Yr58,条锈病成株抗性
B类：
分离分析,快速定位,成株期,抗条锈病基因,国际玉米小麦改良中心,CIMMYT,春小麦,选系,小麦条锈病,F2,家系,遗传群体,杨凌,川江,江油,病害调查,BSA,660K,3B,短臂,挖掘出,SNP,等位基因,因特,AQP,作图,QTL,可解释,表型变异,AX,cM,Mb,基因组信息,比较基因组分析,不同材料,小片,倒位,共线性,单倍型分析,连锁标记,传位,条锈病抗性,抗性表现,育种,种系,系谱,关系需要,快速锁定,锁定目标,记分
AB值：
0.335975
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