典型文献
基于GEO基因芯片结合网络药理学和分子对接技术探究火把花根片治疗IgA肾病的作用机制
文献摘要：
目的 基于GEO基因芯片及网络药理学和分子对接技术探究火把花根片(HBHGT)治疗IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)的作用机制.方法 从DrugBank、OMIM、GeneCards3个疾病数据库结合GEO基因芯片获得IgAN的疾病靶点.从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、本草组鉴、BAT-MAN-TCM 3个中药数据库、相关文献以及SwissTargetPrediction数据库获得HBHGT的主要成分和靶点.对HBHGT-IgAN交集利用STRING构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选出关键靶点.进行基因本体(gene ontology,GO)注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析后对关键成分及关键靶点进行分子对接验证.结果 HBHGT治疗IgAN的核心成分为雷公藤红素、雷公藤甲素等,核心靶点有白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、纤维连接蛋白1(fibronectin1,FN1)、白蛋白(albumin,ALB)等,分子对接显示大部分靶点与成分有着较好的结合活性.HBHGT治疗IgAN通路主要有核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)、磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等信号通路.结论 火把花根片可通过多靶点、多通路来介导免疫和炎症反应,修复血管损伤,改善肾脏炎症,减少蛋白尿及血尿,延缓IgAN的进展,以达到治疗IgAN的效果.
文献关键词：
GEO基因芯片;火把花根片;IgA肾病;网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号：
作者姓名：
秦苏杨;任秋安;王耀光
作者机构：
天津中医药大学第一附属医院,天津 300193;国家中医针灸临床医学研究中心,天津 300193
文献出处：
引用格式：
[1]秦苏杨;任秋安;王耀光-.基于GEO基因芯片结合网络药理学和分子对接技术探究火把花根片治疗IgA肾病的作用机制)[J].湖南中医药大学学报,2022(08):1319-1328
A类：
HBHGT,GeneCards3,fibronectin1
B类：
GEO,基因芯片,网络药理学,分子对接技术,技术探究,火把花根片,肾病,nephropathy,IgAN,DrugBank,OMIM,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,本草,BAT,MAN,中药数据库,SwissTargetPrediction,交集,STRING,蛋白互作,protein,interaction,PPI,关键靶点,基因本体,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,富集分析,关键成分,核心成分,雷公藤红素,雷公藤甲素,核心靶点,interleukin,纤维连接蛋白,FN1,albumin,ALB,结合活性,核因子,nuclear,磷脂酰肌醇,phosphoinositide,kinase,PI3K,蛋白激酶,Akt,tumor,necrosis,多靶点,多通路,血管损伤,肾脏炎症,少蛋,蛋白尿,血尿
AB值：
0.351366
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