典型文献
茶树GELP基因家族的鉴定与表达分析
文献摘要：
从拟南芥数据库中获得GELP基因家族注册号,运用生物信息学分析的方法,在茶树数据库中得到了GELP基因家族成员86个,这些基因可分为9个亚族.其编码蛋白的氨基酸数为171～753,理论等电点为4.35～9.48,蛋白质分子量为18.59419～84.55054 kDa.基因结构分析表明,有3条基因只有2个外显子,其余基因外显子数3～13.对上游2 kb区域启动子顺式作用元件分析表明,该基因家族成员对逆境胁迫应答MYB响应明显,除CsGELP16、CsGELP24、CsGELP56、CsGELP61、CsGELP77、CsGELP80外,其他基因均对抗寒元件识别位点MYC响应明显.转录组数据分析表明,CsGELP79、CsGELP64、CsGELP86、CsGELP4分别在Cold、PEG、NaCl、MeJA等处理下上调显著,表明基因CsGELP79响应寒冷胁迫,CsGELP64响应干旱胁迫,CsGELP86响应高盐胁迫,CsGELP4响应抵抗病虫害.此外,CsGELP1、CsGELP12、CsGELP14、CsGELP15、CsGELP18、CsGELP32、CsGELP55在各种处理下均表现为下调,说明这些基因在抗逆胁迫中起负调节作用.
文献关键词：
茶树;GELP基因家族;转录组分析;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
张在宝;王雪珂;王朔;孙萌柯;陈佳慧;王思雨
作者机构：
信阳师范学院 生命科学学院/河南省茶树生物学重点实验室,河南 信阳 464000
文献出处：
引用格式：
[1]张在宝;王雪珂;王朔;孙萌柯;陈佳慧;王思雨-.茶树GELP基因家族的鉴定与表达分析)[J].信阳师范学院学报（自然科学版）,2022(01):36-44
A类：
GELP,CsGELP16,CsGELP24,CsGELP56,CsGELP61,CsGELP77,CsGELP80,CsGELP79,CsGELP64,CsGELP86,CsGELP4,CsGELP1,CsGELP12,CsGELP14,CsGELP15,CsGELP18,CsGELP32,CsGELP55
B类：
茶树,基因家族,表达分析,拟南芥,注册号,生物信息学分析,编码蛋白,等电点,分子量,kDa,基因结构,外显子,kb,启动子,顺式作用元件,逆境胁迫应答,MYB,抗寒,MYC,转录组数据,Cold,PEG,NaCl,MeJA,寒冷胁迫,干旱胁迫,高盐胁迫,抗病虫害,抗逆,转录组分析
AB值：
0.226727
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