目的 通过网络药理学和分子对接,预测柴胡疏肝散(Chai Hu Shu Gan San,CHSGS)治疗肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的分子靶点,构建预后模型和列线图.方法 从TCGA和GEO数据库筛选出差异表达基因、加权共表达基因和聚类模块与正常组的差异基因;将四者取交集,得到HCC发生发展密切相关的基因;从TCMSP和SymMap数据库下载CHSGS的化合物和靶点,进一步将CHSGS的靶点与HCC相关基因进行取交集得到治疗HCC相关靶点,将其治疗HCC相关靶点进行GO和KEGG功能富集分析;使用SymMap数据库,构建CHSGS治疗HCC"病-证-方/药"网络.将PPI和构建的药物靶点网络取交集,得到核心的靶点,进一步使用cox LASSO回归分析构建相关的预后模型;结合临床性状使用单因素和多因素cox分析构建列线图;使用分子对接评估分子靶点的结合情况.使用人类蛋白质图谱(HPA)数据库进行核心靶点的免疫组织化学染色验证.结果 得到了HCC发生发展密切相关基因890个.CHSGS治疗HCC靶点38个.GO和KEGG分析显示,CHSGS治疗HCC可能与对无机物的反应、类固醇代谢过程和对细胞外刺激的反应有关;CHSGS治疗HCC可能与FOXM1信号通路有关.cox LASSO回归构建了预后模型,其模型公式为:(0.1165)*CCNB1+(-0.0396)*PON1+(0.0888)*CHEK1+(0.0521)*SPP1+(0.0093)*NQO1+(0.0102)*SERPINE1+(0.0012)*IGFBP3.单因素cox联合多因素cox分析显示,ESR1、T分期是独立的预后危险因素.列线图结果 显示,其c-index为0.622,P<0.001.分子对接结果 显示,异鼠李素与ESR1的结合良好.免疫组织化学染色结果 在蛋白质水平验证了结果 的准确性.结论 异鼠李素可能是CHSGS治疗HCC的主要成分之一,CHSGS治疗HCC的靶点用以构建的预后模型可以用于患者预后的评估,根据ESR1的表达水平、T分期构建的列线图可用于患者总体生存率的估算.

网络药理学;生物信息学;柴胡疏肝散;肝细胞癌;分子靶点

张泽鑫;陈祎琦;吴汶丰;黄子怡;林思其;方舒涵;林丽珠;钟崇;李菁

广州中医药大学第一临床医学院 广州 510405;广州中医药大学第二临床医学院 广州 510405;广州中医药大学第一附属医院 广州 510405;湖南中医药大学第一附属医院 长沙 410000

世界科学技术-中医药现代化

[1]张泽鑫;陈祎琦;吴汶丰;黄子怡;林思其;方舒涵;林丽珠;钟崇;李菁-.基于网络药理学和分子对接的柴胡疏肝散及成分治疗肝癌的分子靶点和疗效预测)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(04):1614-1628

Chai,CHSGS,CCNB1+,PON1+,CHEK1+,SPP1+,NQO1+,SERPINE1+

网络药理学,分子对接,柴胡疏肝散,分治,肝癌,分子靶点,疗效预测,Hu,Shu,Gan,San,肝细胞癌,Hepatocellular,carcinoma,HCC,预后模型,列线图,TCGA,GEO,出差,差异表达基因,共表达基因,差异基因,交集,TCMSP,SymMap,下载,功能富集分析,PPI,药物靶点,靶点网络,cox,LASSO,结合临床,估分,类蛋白质,HPA,核心靶点,免疫组织化学染色,无机物,类固醇,代谢过程,FOXM1,IGFBP3,ESR1,预后危险因素,异鼠李素,染色结果,蛋白质水平,总体生存率

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